Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ចូល

ផលិតផល

DNA / RNA បានសរសេរឡើងវិញ -pacbio ស៊េរី

DNA / RNA បានសរសេរឡើងវិញ -pacbio លំដាប់រូបភាពពិសេសរូបភាព

វេទិកាលំដាប់លំដោយពូថ្យូអូគឺជាវេទិកាសរសេរអានរយៈពេលវែងដែលត្រូវបានគេស្គាល់ថាជាបច្ចេកវិទ្យាមួយក្នុងចំណោមបច្ចេកវិទ្យាមួយក្នុងចំណោមបច្ចេកវិទ្យាលំដាប់ជំនាន់ទី 3 (TGS) បច្ចេកវិទ្យា។ បច្ចេកវិទ្យាស្នូលដែលជាពេលវេលាម៉ូលេគុលតែមួយគ្រឿងដែលផ្តល់អំណាចដល់ជំនាន់នៃការអានជាមួយប្រវែងរាប់សិបនៃគីឡូ។ នៅលើមូលដ្ឋាននៃ "លំដាប់លេខល្ពៅ - ដោយការធ្វើត្រាប់តាមស្នូលនៃនុយក្លេអ៊ែរត្រូវបានសម្រេចដោយ Weave-Mode (zMW) ដែលជាកន្លែងដែលមានកម្រិតនៅខាងក្រោម (ទីតាំងនៃម៉ូលេគុល) ត្រូវបានបំភ្លឺ។ លើសពីនេះទៀតការសរសេរលេខ SMRT បានចៀសវាងភាពលំអៀងជាក់លាក់នៃប្រព័ន្ធ NGS ក្នុងករណីដែលភាគច្រើននៃ PCR មិនចាំបាច់មាននៅក្នុងដំណើរការសាងសង់បណ្ណាល័យទេ។

វេទិកា: រឿងភាគទី 2 អ៊ីអូ

ទាក់ទងមកយើងខ្ញុំ

ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលនៃការបង្ហាញ

លក្ខណៈពិសេស

របៀបសរសេរពីរនៅលើឡេប៊ូជីជីវាណ: អានបន្តជាយូរមកហើយ (CLR) និងការអានរាងជារង្វង់វែង (ស៊ីស៊ីអេសអេស)

របៀបលំដាប់

ទំហំបណ្ណាល័យ

ទិន្នន័យទ្រឹស្តីទិន្នផល (ក្នុងមួយកោសិកា)

មានតែមួយការត្យេងតាត់

កម្មវិធី

ឯកកុរតី

20kb, 30kb, ល។

80 ជីកាបៃទៅ 130 ជីកាបៃ

ប្រហាក់ប្រហែល។ 85%

ដឺណូណូ, ការហៅទូរស័ព្ទ SV, ។ ល។

ស៊ីស៊ីអេស

15-20 KB

ពី 14 ទៅ 40 ជីកាបៃជីប / ក្រឡា (ចម្រៀងទី 2)

70 ទៅ 110 ជីកាបៃ / ក្រឡា (revio)

អាស្រ័យលើគំរូ

ប្រហាក់ប្រហែល។ 99%

ដឺណូណូ, snp snp / indel / ការហៅទូរស័ព្ទ SV, ISO-SEQ,

ការប្រៀបធៀបនៃការសម្តែងនិងលក្ខណៈពិសេសនៃ revio និង Sequel II

ល័ក្ខខ័ណ្ឌ	ប្រព័ន្ធបន្តបន្ទាប់ II II	ប្រព័ន្ធ Revio	ផាបបង្កើន
ដង់ស៊ីតេខ្ពស់	8 លាន Zmws	25 លាន Zmws	3x
ដំណាក់កាលឯករាជ្យ	1	4	4x
ពេលវេលារត់ខ្លីជាងនេះ	30 ម៉ោង	24 ម៉ោង	1.25x
Hifi Hifi Fianomes របស់មនុស្ស / ឆ្នាំ	88	1.300	1សរុប 5 ដង

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

●មានបទពិសោធន៍ជាង 8 ឆ្នាំលើវេទិកាលំដាប់ប៉ាស៊ីហ្វិកដែលមានគម្រោងបិទទ្វាររាប់ពាន់ដែលមានប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។

●បំពាក់យ៉ាងពេញលេញនូវវេទិកាចម្រៀងពត៌មានពាសពេញពើស៊ីជីអូស៊ីឌីដើម្បីធានាបាននូវការដាក់ទំរង់គ្រប់គ្រាន់។

●បត់វេនលឿនជាងមុនម៉ោងទិន្នន័យកាន់តែខ្ពស់និងទិន្នន័យត្រឹមត្រូវជាងមុន។

●បានចូលរួមចំណែកក្នុងការបោះពុម្ពផ្សាយដែលមានមូលដ្ឋានលើ PacBio ដែលមានឥទ្ធិពលខ្ពស់។

តម្រូវការគំរូ

ប្រភេទគំរូ

ចមនយន

ការផ្តោតអារម្មណ៍ (Quitber®)

ចមនយន

ភាពបរិសុទ្ធ

ផ្សេងៗ

ឌីអិនអេហ្សិក

អាស្រ័យលើតម្រូវការទិន្នន័យ

≥50 ng / μl

≥15μអិល

អូឌីអេ 26/280 = 1.7-2.2;
អូឌីអេស 60/230 = 1.8-2.5;
កំពូលជម្រះនៅ 260 អិម,គ្មានការចម្លងរោគ

ការផ្តោតអារម្មណ៍ចាំបាច់ត្រូវវាស់ដោយ quipit និង qubit / nanopore = 0.8-2.5

RNA សរុប

≥1.2μg

≥120 ng / μl

≥15μអិល

អូឌីអេស 60/280 = 1.7-2.5;
អូឌីអេស 60/230 = 0.5-2.5;គ្មានការចម្លងរោគ

rin តម្លៃ≥7.5

5128s / 18S≥1

លំហូរការងារសេវាកម្ម

ការរៀបចំគំរូ

សំណង់បណ្ណាល័យ

ការវយបវនយឹង

ការវិភាគទិន្នន័យ

ការផ្តល់គម្រោង

មុន: ក្រុមហ៊ុនផលិត MRNA របស់ក្រុមហ៊ុន MRNA MRNA សេវាកម្ម - ក្រុមហ៊ុនផលិតតាមលំដាប់លំដោយដែលមិនមែនជាកូដ

បន្ទាប់: បណ្ណាល័យដែលផលិតបានមុនធ្វើឱ្យថ្មី

ទិន្នផលទិន្នន័យផ្ទះ

ទិន្នន័យដែលបង្កើតពីកោសិកាចំនួន 63 ស៊ីស៊ីអេស (ពី 26 ប្រភេទ)

តិន្នន័យ-pacbio-ccs-15 kb	មធ្យម	អស្ដី	នាទី	សរេកាយ
ទិន្នផល - ការសង្គ្រោះ (ជីកាបៃ)	421.12	544.27	221.38	426.58
យាយ - ស៊ីស៊ីអេសអេសអេសអេសអេស	25.93	38.59	10.86	25.43
polymerase n50	145.651	175.430	118,118	144.689
subeads n50	17.509	23.924	12.485	17.584
CCS N50	14.490	19.034	9.876	14.747
ប្រវែងមធ្យម - វត្ថុធាតុ polymase	67.995	89.379	49.664	66.433
ការចែកចាយរយៈពេលប្រវែងមធ្យម	15.866	21.036	11.657	16.012
ប្រវែងមធ្យម - ស៊ីស៊ីអេស	14.489	19.074	8.575	14.655

ទិន្នន័យដែលបានបង្កើតពីកោសិកា CLR (ពី 76 ប្រភេទ)

ទិន្នន័យ -pacbio-clr-30kb	មធ្យម	អស្ដី	នាទី	សរេកាយ
ទិន្នផល - ការសង្គ្រោះ (ជីកាបៃ)	142.20	291.40	50.55	142.49
polymerase n50	39.456	121.191	15.389	35.231
subeads n50	28,490	41.012	14.430	29.063
ប្រវែងមធ្យម - វត្ថុធាតុ polymase	22.063	48,886	8.747	21.555
ការចែកចាយរយៈពេលប្រវែងមធ្យម	17.720 នាក់	2725	8.293	17.779

2.data QC - ការបង្ហាញស្ថិតិលើទិន្នផលទិន្នន័យ

វត្ថុចាកមរុ	ស៊ីស៊ីអានលេខ	មូលដ្ឋាន CCS សរុប (BP)	ស៊ីស៊ីអេសអាន N50 (BP)	CCS មានប្រវែង (BP)	ការអានយូរបំផុតរបស់ស៊ីស៊ីអេសអេស (ប៊ីភី)	មូលដ្ឋានព័ត៌មានមូលដ្ឋាន (BP)	អត្រាស៊ីស៊ីអេស (%)
PB_BMKXXX	3.444.159	54,164,12222586	15.728	15.726	36,110	863,326.330.330.465	6.27