T2T геномдық құрастыру, Gap Тегін геном
1stЕкі күріш геномы1
Атауы: Сиандық / индикаторға арналған Gad-геномдық геномдарды құрастыру және тексеру Центромер архитектурасының өсімдігін ашады
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Орналастырылған уақыт: 2021 жылғы 1 қаңтар.
Институт: Хуажонг Аграрлық университеті, Қытай
Материалдар
O. SATIVA xian / IndicaКүріш сорттары «Женхан» 97 (ZS97) 'және' Mh63 (MH63)
САЯСАТ САЯСАТЫ
Ngs оқиды + Hifi оқылымдары + CLED READS3 CLR оқу + Bionano + Hi-C
Деректер:
ZS97: 8.34 GB (~ 23x) HIFI оқылады + 48.39 ГБ (~ 131x) ЖШ оқылады + 25 ГБ (~ 69x) ngs + 2 bionano irys gers
MH63: 37.88 GB (~ 103x) HIFI оқылады + 48.97 ГБ (~ 132x) ЖШ оқылады + 28 ГБ (~ 76x) ngs + 2 bionano irys gers
1-сурет. Күріштің екі алшақтықты геномдары (MH63 және ZS97)
2ndБанан геномы2
Тақырып: Теломер-Тельомера-Тельомера-Теломера-Теломер Хромосомалар Нанопордың реттілігін қолданып банан
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Орналастырылған уақыт: 2021 жылғы 17 сәуір.
Институт: Париж-Саилай университеті, Франция
Материалдар
Қос гаплоидМуса авууминатажомақмалакенсис(Dh-pahang)
Тиептілік стратегиясы және мәліметтер:
Hiseq2500 PE250 режимі + Минион / Прометион (93 ГБ, ~ 200x) + Оптикалық карта (DLE-1 + BSPQ1)
1-кестеде Musa Acuminata (Dh-Pahang) геном жинақтарын салыстыру
Сурет 2 Musa Genomes архитектурасын салыстыру
3rdPhaeodactyLum Tricornutum геномы3
Тақырып: Теломер-Тельомера геномдық құрастыруP
Хаодакталды-Tricortuum
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Орналастырылған уақыт: 04 мамыр, 2021 ж
Институт: Батыс университеті, Канада
Материалдар
Phaeodactylum tricortuum(Балдырлардың мәдениеті және «Протозо» CCAP 1055/1)
Тиептілік стратегиясы және мәліметтер:
1 Оксфорд Нанопордың анопоры ағындары
3-сурет Теломер-Тельомерияға арналған геномдық құрастыру үшін жұмыс процесі
4thChm13 геномы4
Тақырып: Адам геномының толық тізбегі
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
Орналастырылған уақыт: 27 мамыр, 2721 ж
Институт: Ұлттық денсаулық сақтау институттары (NIH), АҚШ
Материалдар: CHM13 ұялы сызығы
Тиептілік стратегиясы және мәліметтер:
30 × Pacbio Circulsus Sequence (HIFI), 120 × Оксфорд Нанопор Ультра Ұзартылған Севенент, 100 × Илмина ПТР ТЕГІН ТЕГІН ТЕГІН ТЕГІН ТЕМЕКЦИПАТТАЦИЯ / ARIMA Genomics Hi-C (Hi-C), Бионано оптикалық карталары, және строн-Сек
2-кесте, GRCH38 және T2T-CHM13 адам геномдық жинақтарын салыстыру
Сілтеме
1.Сергей Нурк және басқалар. Адам геномының толық тізбегі. Биорсив 2021.05.26.445798; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Каролин Belser et al. Nanopore реттілігін қолдана отырып, бананның теломера-TE-TO-TOMOSOMES. Биорсив 2021.04.16.440017; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al. Phaeodactylum Tricortulum геномдық ассамблеясы. Биорсив 2021.05.04.442596; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.jia-ming song et al. Сиандық / индикаторға арналған Gap-тегін анықтамалық геномдарды құрастыру және тексеру Centromere архитектурасының өсімдігін ашады. Биорсив 2020.12.24.424073; Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
POST TIME: қаңтар-06-2022