ГЕНОМ
Хромосома масштабындағы жинақтау және биомасса дақылының Miscanthus lutarioriparius геномын талдау
Нанокесектік секвенирлеу | Illumina | Hi-C | РНҚ-секвенирлеу | Филогенез
Бұл зерттеуде Biomarker Technologies нанопора секвенциясы, жаңа геномды құрастыру, Hi-C көмегімен жинақтау және т.б. бойынша техникалық қолдау көрсетті.
Аннотация
Мискантус, ризоматозды көпжылдық өсімдік, оның жоғары биомассасы мен стресске төзімділігі үшін биоэнергия өндіру үшін үлкен әлеуетке ие. Біз хромосома масштабындағы жинақты хабарлаймызMiscanthus lutarioripariusОксфордтық Nanopore секвенциясы мен Hi-C технологияларын біріктіру арқылы геном. 2,07 Гб жинақ геномның 96,64%-ын қамтиды, N50 контиг 1,71 Мб. Центромера және теломера тізбегі сәйкесінше барлық 19 хромосома және 10 хромосома үшін жинақталған. M. lutarioriparius аллотетраплоидты шығу тегі центромерлі спутниктік қайталаулар арқылы расталады. Құмайға қатысты тетраплоидты геномдық құрылым және бірнеше хромосомалық қайта құрулар анық көрсетілген. Тандемді дубликат гендеріM. lutarioripariusОлар стресске жауап берумен ғана емес, сонымен қатар жасуша қабырғасының биосинтезімен байланысты функционалды байытылған. Ауруға төзімділікке, жасуша қабырғасының биосинтезіне және металл иондарын тасымалдауға байланысты гендік отбасылар айтарлықтай кеңейіп, дамыған. Бұл отбасылардың кеңеюі тамаша белгілерді жақсарту үшін маңызды геномдық негіз болуы мүмкінM. lutarioriparius.
Геномды құрастырудың негізгі статистикасы
Сурет. M. lutarioriparius геномдық жиынына шолу
Жаңалықтар мен маңызды оқиғалар соңғы сәтті жағдайларды Biomarker Technologies-пен бөлісуге, жаңа ғылыми жетістіктерді, сондай-ақ зерттеу барысында қолданылатын көрнекті әдістерді түсіруге бағытталған.
Жіберу уақыты: 05 қаңтар 2022 ж