mRNA-seq (NGS) - De novo
мРНҚ секвенирлеуі белгілі бір жағдайларда жасушалардағы барлық мРНҚ транскрипттерінің профилін жасауға мүмкіндік береді және әртүрлі зерттеу салаларында кеңінен қолданылатын технология болып табылады. BMKCloud De novo mRNA-seq құбыры анықтамалық геном болмаған кезде поли-А байытылған секвенирлеу кітапханаларын талдауға арналған. Құбыр сапаны бақылаудан басталады, содан кейінжаңадантранскрипт құрастыру және униген жиынын таңдау. Унигендік құрылымды талдау кодтау ретін (CDS) және қарапайым тізбекті қайталауды (SSR) болжайды. Кейіннен дифференциалды экспрессиялық талдау сыналған шарттар арасында дифференциалды экспрессияланған гендерді (DEG) табады, содан кейін биологиялық түсініктерді алу үшін функционалдық аннотация және DEG байытылады.
Биоинформатика
