Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Өнімдер

Геномдық қауымдастықтың талдауы

Genome-Wide Association Studies (GWAS) мақсаты белгілі бір белгілерге (фенотиптерге) байланысты генетикалық нұсқаларды (генотиптерді) анықтау болып табылады. Көптеген адамдарда бүкіл геном бойынша генетикалық маркерлерді мұқият зерттей отырып, GWAS популяция деңгейіндегі статистикалық талдаулар арқылы генотип-фенотиптік бірлестіктерді экстраполяциялайды. Бұл әдістеме адам ауруларын зерттеуде және жануарлар мен өсімдіктердегі күрделі белгілерге қатысты функционалдық гендерді зерттеуде кең қолданбаларды табады.

BMKGENE-де біз үлкен популяцияларда GWAS жүргізудің екі әдісін ұсынамыз: толық геномды реттілік (WGS) қолдану немесе төмендетілген өкілдік геномды реттілік әдісін таңдау, үйде әзірленген ерекше локусты күшейтілген фрагмент (SLAF). WGS кішірек геномдарға сәйкес келсе, SLAF геномдары ұзағырақ үлкен популяцияларды зерттеу үшін үнемді балама ретінде пайда болады, секвенирлеу шығындарын тиімді азайтады, сонымен бірге генетикалық маркерді ашудың жоғары тиімділігіне кепілдік береді.


Қызмет мәліметтері

Биоинформатика

Демо нәтижесі

Таңдаулы жарияланымдар

Жұмыс барысы

图片13

Қызметтің артықшылықтары

Кең көлемдегі сараптама және жарияланым жазбалары: GWAS-те жинақталған тәжірибесі бар BMKGene GWAS популяциясын зерттеуде жүздеген түр жобаларын аяқтады, зерттеушілерге 100-ден астам мақалаларды жариялауға көмектесті және жиынтық әсер ету коэффициенті 500-ге жетті.

● Жан-жақты биоинформатика талдауы: жұмыс процесі кандидат гендер жинағын және олардың сәйкес функционалдық аннотациясын жеткізетін SNP-белгілердің ассоциациясын талдауды қамтиды.

Жоғары білікті биоинформатика командасы және қысқаша талдау циклі: озық геномикалық талдауда үлкен тәжірибесі бар BMKGene командасы жылдам өңдеу уақытымен жан-жақты талдаулар береді.

Сатудан кейінгі қолдау:Біздің міндеттеме сатылымнан кейінгі 3 айлық қызмет көрсету мерзімімен жобаны аяқтағаннан кейін де кеңейеді. Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез келген сұрауларды шешу үшін жобаны бақылауды, ақаулықтарды жою бойынша көмекті және сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.

Қызмет көрсету ерекшеліктері мен талаптары

Тізбектеу түрі

Ұсынылатын популяция масштабы

Тізбектеу стратегиясы

Нуклеотидтерге қойылатын талаптар

Тұтас геномды реттілік

200 үлгі

10x

Концентрация: ≥ 1 нг/ мкл

Жалпы сома≥ 30 нг

Шектеулі немесе тозу немесе ластану жоқ

Арнайы локусты күшейтілген фрагмент (SLAF)

Тег тереңдігі: 10x

Тегтер саны:

< 400 Мб: WGS ұсынылады

< 1Гб: 100K тегтер

1 Гб

> 2Гб: 300K тегтер

Ең көбі 500 мың тег

Концентрация ≥ 5 нг/мкл

Жалпы сомасы ≥ 80 нг

Nanodrop OD260/280=1,6-2,5

Агароза гелі: деградация немесе ластану жоқ немесе шектеулі

 

Материалды таңдау

动物1
动物2
сурет7

Әртүрлі сорттар, кіші түрлер, жер нәсілдері/гендік банктер/аралас тұқымдастар/жабайы ресурстар

Әртүрлі сорттар, түршелер, ландрасалар

Жартылай отбасы/толық отбасы/жабайы ресурстар

Қызметтің жұмыс ағыны

QC үлгісі

Эксперимент дизайны

үлгіні жеткізу

Үлгіні жеткізу

Пилоттық эксперимент

РНҚ экстракциясы

Кітапханаға дайындық

Кітапхана құрылысы

Тізбектеу

Тізбектеу

Деректерді талдау

Деректерді талдау

Сатудан кейінгі қызметтер

Сатудан кейінгі қызметтер


  • Алдыңғы:
  • Келесі:

  • 图片119

    Келесі талдауды қамтиды:

    • Геномдық қауымдастықтың талдауы: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM моделі
    • Кандидаттық гендердің функционалды аннотациясы

    SNP-сипат ассоциациясының талдауы - Манхэттен сюжеті

     

    图片14

     

    SNP-сипат ассоциациясының талдауы – QQ сюжеті

     

    图片15

     

     

    BMKGene's de GWAS қызметтері септігін тигізетін жетістіктерді жарияланымдар жинағы арқылы зерттеңіз:

    Lv, L. et al. (2023) «Геномдық қауымдастықты зерттеу арқылы Sinonovacula constricta ұстарасының аммиак төзімділігінің генетикалық негіздерін түсіну»,Аквакультура, 569, б. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.

    Ли, X. және т.б. (2022) «Түлкіқұйрық тарысының 398 қосылуының мульти-омикалық талдауы үй шаруашылығына, метаболиттік қасиеттерге және қабынуға қарсы әсерлерге байланысты геномдық аймақтарды анықтайды',Молекулярлық өсімдік, 15(8), 1367–1383 беттер. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.

    Ли, Дж. және т.б. (2022) «Құрғақшылық ортадағы қабықсыз фенотиптердің кең геномдық ассоциациясының картасы»,Өсімдіктанудағы шекаралар, 13, б. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.

    Чжао, X. және т.б. (2021) 'Сульфотрансферазаны кодтайтын GmST1 соя мозаикалық вирусының G2 және G3 штамдарына төзімділік береді',Өсімдік, жасуша және қоршаған орта, 44(8), 2777–2792 беттер. doi: 10.1111/PCE.14066.

    дәйексөз алыңыз

    Хабарламаңызды осы жерге жазып, бізге жіберіңіз

    Хабарламаңызды бізге жіберіңіз: