СКГРЕГЕНТТІҢ ТАЛДАУЫ
Қызметтің артықшылықтары
Такаги және басқалар, зауыт журналы, 2013 ж
● Дәл локализация: шамдарды 30 + 30-дан 200 + 200-ге дейін араластыру, фондық шуды азайту; Синхимациялық емес мутатранттарға негізделген кандидатураға болжам.
● Жан-жақты талдау: тереңдетілген кандидаттық гендік, оның ішінде NR, Swissprot, Go, KGG, KOG, KOG және т.б.
● Тезірек бұрылу уақыты: 45 жұмыс күні ішінде жылдам гендік локализация.
.
Қызмет көрсету ерекшеліктері
Халық:
Қарама-қарсы фенотиптермен ата-аналардың ұрпақты бөлінуі.
мысалы, F2 Progeny, BackCrossing (BC), рекомбинантты инбред (RIL)
Араластыру бассейні
Сапалы белгілер үшін: 30-дан 50-ден 50-ге дейін (кем дегенде 20) / үйінді
Сандық тратис үшін: бүкіл популяциядағы экстремалды фенотиптері бар адамдардан 10% -дан 10% -ға дейін (кем дегенде 30 + 30).
Ұсынылатын дәйектілік тереңдігі
Кем дегенде 20x / ата-ана және 1x / ұрпақтар (мысалы, алшақтама 30 + 30 бассейні үшін, 30 + 30 бассейні үшін, ұзартқыш тереңдігі)
Биоинформатикалар анализдер
● жалпы геномды қалпына келтіру
● Деректерді өңдеу
● SNP / Indel қоңырауы
● кандидат аймақтық скрининг
● кандидаттар гені туралы аннотация
Үлгі талаптары және жеткізу
Үлгі талаптары:
Нуклеотидтер:
| GDNA үлгісі | Тіндердің үлгісі |
| Концентрация: ≥30 NG / мкл | Өсімдіктер: 1-2 г. |
| Сомасы: ≥2 мкг (v15 мкл) | Жануарлар: 0,5-1 г |
| Тазалық: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | Бүкіл қан: 1,5 мл |
Қызмет көрсету ағымы
Эксперимент дизайны
Үлгіні жеткізу
РНҚ алу
Кітапхана құрылысы
Жүйелі кідіріс
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
1. Эсклидтік қашықтықтағы (ЭСК) облыстың аймағын анықтау үшін ассоциацияны талдау базасы. Келесі суретте
Х-осі: хромосома нөмірі; Әр нүкте SNP мәнін білдіреді. Қара сызық орнатылған мәнге сәйкес келеді. Жоғары деңгейдегі мән сайт пен фенотип арасындағы едәуір маңызды қауымдастықты көрсетеді. Қызыл сызық сызығы маңызды бірлестіктің табалдырығын білдіреді.
2.Соцокациялық талдау негізінде SNP-индексіне негіз жоқ
Х-осі: хромосома нөмірі; Әр нүкте SNP-индекс мәнін білдіреді. Қара сызық SNP-индексінің орнатылған мәніне арналған. Мәні неғұрлым үлкен болса, Қауымдастық неғұрлым маңызды болып табылады.
BMK корпусы
FNL7.1 негізгі әсерлі сандық белгілері Кешіктірілген эмбриогенезді кодтайды, қиярдың мойнының ұзындығымен байланысты
Жарияланған категория: Өсімдіктер биотехнологиялық журналы, 2020
САЯСАТ САЯСАТЫ:
Ата-аналар (jin5-508, yn): Жалпы геномды 34 × және 20 ×.
ДНҚ бассейндері (50 ұзын және 50 қысқа мойын): 61 × және 52 × үшін қалпына келтіру
Негізгі нәтижелер
Осы зерттеуде тұрғындар (F2 және F2: 3) jin5-508 және қысқа мойын мен қысқа мойындық сызықты кесіп өту арқылы пайда болды. Екі ДНҚ бассейндері 50 экстремалды ұзын мойын және 50 экстремалды қысқа мойындар салынды. BSA талдау және дәстүрлі Qtl картографиясы бойынша QTL негізгі әсері CHT07-де анықталды. Кандидат аймағы бұдан әрі кесілген, гендік экспрессияны сандық және трансгендік тәжірибелермен азайтылды, олар мойынның ұзындығын бақылауда, CSFNL7.1. Сонымен қатар, CSFNL7.1-де полиморфизм тиісті өрнекпен байланысты болды. Әрі қарай филогенетикалық талдау FNL7.1 Locus Үндістаннан шығуы мүмкін деп болжайды.
 BSA талдауындағы QTL-картографиясындағы Куыш мойынының мойынның ұзындығымен байланысты аймақты анықтау |  Chr07-де анықталған қиярдың мойындық ұзындығының профильдері |
Xu, x, et al. «FNL7.1-тің негізгі әсерлік сандық белгісі кеш эмбриогенезді кодтайды. Өсімдіктер биотехнологиясы 18.7 (2020) журналы.
