მთელი ტრანსკრიპციული თანმიმდევრობა - ილუმინა
თვისებები
● ორმაგი ბიბლიოთეკა, რომ თანმიმდევრობა მოახდინოს სრული ტრანსკრიპციით: rRNA დაქვეითება, რასაც მოჰყვება PE150 ბიბლიოთეკის მომზადება და ზომების შერჩევა, რასაც მოჰყვება SE50 ბიბლიოთეკის მომზადება
● სრული ბიოინფორმატიკის ანალიზი mRNA, lncRNA, circRNA და miRNA ცალკეულ ბიოინფორმატულებში
● ყველა რნმ -ის გამოხატვის ერთობლივი ანალიზი კომბინირებულ მოხსენებაში, მათ შორის CERNA ქსელების ანალიზით.
მომსახურების უპირატესობები
●მარეგულირებელი ქსელების სიღრმისეული ანალიზი: CERNA ქსელის ანალიზს საშუალებას აძლევს mRNA, lncRNA, CircRNA და miRNA ერთობლივი თანმიმდევრობით და ამომწურავი ბიოინფორმაციული სამუშაო პროცესით.
●ყოვლისმომცველი ანოტაცია: ჩვენ ვიყენებთ მრავალ მონაცემთა ბაზას, რათა განვსაზღვროთ განსხვავებულად გამოხატული გენები (DEG) და შევასრულოთ შესაბამისი გამდიდრების ანალიზი, რაც უზრუნველყოფს უჯრედულ და მოლეკულურ პროცესებს, რომლებიც ემყარება ტრანსკრიპციულ პასუხს.
●ფართო ექსპერტიზა: სხვადასხვა კვლევის დომენში 2100 -ზე მეტი ტრანსკრიპციული პროექტის წარმატებით დახურვის ჩანაწერით, ჩვენს გუნდს ყველა პროექტში უამრავი გამოცდილება მოაქვს.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვასრულებთ ძირითადი საკონტროლო წერტილებს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან თანმიმდევრობით და ბიოინფორმატიკით. ეს დეტალური მონიტორინგი უზრუნველყოფს თანმიმდევრულად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას.
●გაყიდვების მხარდაჭერა: ჩვენი ვალდებულება ვრცელდება პროექტის დასრულების მიღმა, 3 თვიანი გაყიდვის სერვისის პერიოდის განმავლობაში. ასე
ნიმუშის მოთხოვნები და მიწოდება
| ბიბლიოთეკა | თანმიმდევრობის სტრატეგია | რეკომენდებულია მონაცემები | ხარისხის კონტროლი |
| rRNA გაფუჭდა | Illumina PE150 | 16 გბ | Q30≥85% |
| ზომა არჩეული | Illumina SE50 | 10-20 მ კითხულობს |
ნიმუშის მოთხოვნები:
ნუკლეოტიდები:
| Conc. (ნგ/μl) | თანხა (μg) | სიწმინდე | პატიოსნება |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 გელზე ნაჩვენები ცილის ან დნმ -ის დაბინძურება. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; შეზღუდული ან საწყისი საწყისი სიმაღლე |
რეკომენდებული ნიმუშის მიწოდება
კონტეინერი: 2 მლ ცენტრიფუგის მილის (კალის კილიტა არ არის რეკომენდებული)
ნიმუშის ეტიკეტირება: ჯგუფი+განმეორება EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
გადაზიდვა:
1. მშრალი ყინა: ნიმუშები უნდა შეფუთონ ჩანთებში და დაკრძალონ მშრალ ყინულებში.
2. Rnastable მილები: რნმ -ის ნიმუშები შეიძლება გამხმარი იყოს RNA სტაბილიზაციის მილში (მაგ. Rnastable®) და გაიგზავნება ოთახის ტემპერატურაზე.
სამსახურის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
რნმ -ის მოპოვება
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვების შემდეგ
ბიოინფორმატიკა
RNA გამოხატვის მიმოხილვა
განსხვავებულად გამოხატული გენები
ცერნის ანალიზი
განსხვავებულად გამოხატეს miRNAs და მასთან დაკავშირებული რნმები
გამოიკვლიეთ BMKGENE- ს მიერ განხორციელებული კვლევის წინსვლები, რომლებიც "მთლიანი ტრანსკრიპციული თანმიმდევრობის სერვისებითაა განწყობილი პუბლიკაციების განკურნებული კოლექციის საშუალებით.
დაი, ი. Et al. (2022) 'mRNA- ების, lncRNA- ებისა და miRNA- ების ყოვლისმომცველი პროფილები კაშინ-ბეკის დაავადებებში, რომლებიც გამოვლენილია რნმ-ის თანმიმდევრობით ", მოლეკულური ომები, 18 (2), გვ. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
ლიუ, ნ. ნან და სხვ. (2022) 'მთლიანი სიგრძის ტრანსკრიპტომების ანალიზი APIS Cerana- ს ცივი წინააღმდეგობის ანალიზი ჩანგბაის მთაში, ოვერტინგის პერიოდში.', გენი, 830, გვ. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'მრავალმხრივი ინტეგრაციაზე დაფუძნებული პრიორიტეტული ენდოგენური რნმ-ის რეგულირების ქსელები მცირე უჯრედის ფილტვის კიბოში: მოლეკულური მახასიათებლები და წამლების კანდიდატები', საზღვრები ონკოლოგიაში, 12, გვ. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/Bibtex.
Xu, P. et al. (2022) 'LncRNA/CircRNA-MIRNA-MRNA გამოხატვის პროფილების ინტეგრირებული ანალიზი ცხადყოფს პოტენციურ მექანიზმების ახალ შეხედულებებს ფესვ-კვანძის ნემატოდების საპასუხოდ, არაქისში', BMC Genomics, 23 (1), გვ. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/ფიგურები/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'მთლიანი ტრანსკრიპციული რნმ-ის თანმიმდევრობა ხაზს უსვამს მოლეკულურ მექანიზმებს, რომლებიც დაკავშირებულია ბროკოლში შემდგომი ხარისხის შენარჩუნებასთან, წითელი LED დასხივებით', პოსტჰარვესტის ბიოლოგია და ტექნოლოგია, 188, გვ. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
