სითბოს რუკა
Heatmap ინსტრუმენტი იღებს მატრიცის მონაცემთა ფაილს შეყვანად და საშუალებას აძლევს მომხმარებლებს გაფილტრონ, ნორმალიზონ და დააჯგუფონ მონაცემები. სითბოს რუქების პირველადი გამოყენების შემთხვევა არის გენის ექსპრესიის დონის კლასტერული ანალიზი სხვადასხვა ნიმუშებს შორის.
გენის ანოტაცია
გენის ანოტაციის ინსტრუმენტი ახორციელებს გენის ანოტაციას შეყვანილი FASTA ფაილების თანმიმდევრობით გასწორების საფუძველზე სხვადასხვა მონაცემთა ბაზებთან.
ძირითადი ლოკალური გასწორების საძიებო ინსტრუმენტი (BLAST)
BLAST ინსტრუმენტი არის NCBI BLAST-ის BMKCloud ინტეგრირებული ვერსია და შეიძლება გამოყენებულ იქნას იგივე ფუნქციების შესასრულებლად BMKCloud ანგარიშზე ატვირთული მონაცემების გამოყენებით.
CDS_UTR პროგნოზი
CDS_UTR პროგნოზირების ხელსაწყო შექმნილია კოდირების რეგიონების (CDS) და არაკოდირების რეგიონების (UTR) პროგნოზირებისთვის მოცემულ ტრანსკრიპტის თანმიმდევრობებში BLAST-ის შედეგებზე დაყრდნობით ცნობილი ცილების მონაცემთა ბაზებისა და ORF პროგნოზირების შედეგების წინააღმდეგ.
მანჰეტენის ნაკვეთი
Manhattan Plot ინსტრუმენტი იძლევა მაღალი ნიმუშების ექსპერიმენტების ჩვენებას და ჩვეულებრივ გამოიყენება გენომის მასშტაბური ასოციაციის კვლევებში (GWAS).
ცირკის დიაგრამა
CIRCOS Diagram ინსტრუმენტი უზრუნველყოფს ეფექტურ ვიზუალიზაციას, თუ როგორ ნაწილდება გენომიური ფუნქციები გენომში. საერთო მახასიათებლები მოიცავს რაოდენობრივ ლოკებს, SNP-ებს, InDels-ს, სტრუქტურულ და ასლის ნომრის ვარიანტებს.
გენის ონტოლოგია (GO) გამდიდრება
GO Enrichment ინსტრუმენტი უზრუნველყოფს ფუნქციური გამდიდრების ანალიზს. ამ ხელსაწყოს პირველადი პროგრამული უზრუნველყოფა არის TopGO-Bioconductor პაკეტი, რომელიც მოიცავს დიფერენციალური გამოხატვის ანალიზს, GO გამდიდრების ანალიზს და შედეგების ვიზუალიზაციას.
შეწონილი გენის თანაგამოხატვის ქსელის ანალიზი (WGCNA)
WGCNA არის ფართოდ გამოყენებული მონაცემთა მოპოვების მეთოდი გენის თანაგამოხატვის მოდულების აღმოსაჩენად. იგი გამოიყენება სხვადასხვა გამოხატვის მონაცემთა ბაზაში, მათ შორის მიკრომასივებისა და NGS გენის გამოხატვის მონაცემები.
ინტერპროსკანი
InterProScan ინსტრუმენტი უზრუნველყოფს InterPro ცილის თანმიმდევრობის ანალიზს და კლასიფიკაციას.
GO KEGG გამდიდრება
GO KEGG გამდიდრების ხელსაწყო შექმნილია GO გამდიდრების ჰისტოგრამის, KEGG გამდიდრების ჰისტოგრამის და KEGG გამდიდრების ბილიკის გენერირებისთვის, რომელიც ეფუძნება მოწოდებულ გენთა კომპლექტს და შესაბამის ანოტაციას.