
Pacbio სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპციული
PACBIO სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპციული თანმიმდევრობა, ISOSEQ, საშუალებას აძლევს ტრანსკრიპციის იზოფორმების ზუსტი იდენტიფიცირებას, ალტერნატიულ პოლიადენილაციასა და გაჟონვას და იწვევს გენის გამოხატვის უფრო ზუსტი ანალიზს. BMKCloud Pacbio- ს სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპციული მილსადენი შექმნილია cDNA ბიბლიოთეკების ანალიზისთვის, რომელიც თანმიმდევრულია წრიული კონსენსუსის თანმიმდევრობის (CCS) რეჟიმში და განსაზღვრავს სრულმეტრაჟიანი არა-ქრომერული (FLNC) თანმიმდევრობით, რომლებიც შემდეგ კლასშია არა-ნადირობის ტრანსკრიპციებში. შემდგომი BUSCO– ს ანალიზი აფასებს ტრანსკრიპციული ასამბლეის სისრულეს. შეკრებილი ტრანსკრიპტომიდან ხორციელდება მრავალჯერადი ანალიზები: ალტერნატიული გაჟღენთილი, მარტივი თანმიმდევრობის განმეორება (SSR), lncRNA და შესაბამისი სამიზნე გენების პროგნოზირება, ახალი გენების პროგნოზირება, გენის ოჯახის ანალიზი, ტრანსკრიპციის ფაქტორების ანალიზი და ჩანაწერების ფუნქციური ანოტაცია.
ბიოინფორმატიკა
