ნანოპორის სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპციული

ნანოპორის ტრანსკრიპციული თანმიმდევრობა არის ძლიერი მეთოდი სრულმეტრაჟიანი cDNA– ების თანმიმდევრობით, ტრანსკრიპციის იზოფორმების ზუსტად იდენტიფიცირებისა და რაოდენობრივი დასადგენად. BMKCloud Nanopore სრულმეტრაჟიანი ტრანსკრიპციული მილსადენი მიზნად ისახავს ნანოპორის პლატფორმაზე წარმოქმნილ რნმ-სეკის მონაცემებს მაღალი ხარისხის კარგად ანოტირებული საცნობარო გენომის წინააღმდეგ, რაც უზრუნველყოფს თვისებრივ და რაოდენობრივ ანალიზს როგორც გენის, ისე ტრანსკრიპციის დონეზე. ხარისხის კონტროლის შემდეგ, მიიღება სრულმეტრაჟიანი არა-ქიმერული (FLNC) თანმიმდევრობები და კონსენსუსის თანმიმდევრობით არის მითითებული საცნობარო გენომი, რათა ამოიღონ ზედმეტი ჩანაწერები. ამ ტრანსკრიპციის კომპლექტიდან, გამოხატულება რაოდენობრივად ხდება და განსხვავებულად გამოხატული გენები და ჩანაწერები იდენტიფიცირდება და ფუნქციურად ანოტირდება. მილსადენი ასევე შეიცავს ალტერნატიულ პოლიადენილაციის (APA) ანალიზს, ალტერნატიულ სპლიქსირების ანალიზს, მარტივი თანმიმდევრობის განმეორებით (SSR) ანალიზს, lncRNA- ს და შესაბამისი სამიზნეების პროგნოზირებას, კოდირების რიგითების პროგნოზს (CD), გენის ოჯახის ანალიზი, ტრანსკრიპციის ფაქტორების ანალიზი, ახალი გენების პროგნოზირება და ჩანაწერების ფუნქციური ანოტაცია.