MetAtranscriptome თანმიმდევრობა
მომსახურების თვისებები
● rRNA დაქვეითება, რასაც მოჰყვება მიმართულების mRNA ბიბლიოთეკის მომზადება.
● თანმიმდევრობა Illumina Novaseq– ზე.
მომსახურების უპირატესობები
●შეისწავლეთ რთული მიკრობული თემების ცვლილებები:ეს ხდება ტრანსკრიპციის დონეზე და შეისწავლეთ პოტენციური ახალი გენები.
●მიკრობული საზოგადოების ურთიერთქმედების ახსნა მასპინძელთან ან გარემოსთან.
●ყოვლისმომცველი ბიოინფორმაციული ანალიზი: ეს უზრუნველყოფს თემის ტაქსონომიურ და ფუნქციურ კომპოზიციებს, ასევე დიფერენციალური გენის გამოხატვის ანალიზს.
●ვრცელი გენის ანოტაცია:თანამედროვე გენის ფუნქციის მონაცემთა ბაზების გამოყენებით მიკრობული თემების ინფორმაციული გენის გამოხატვის შესახებ.
●გაყიდვების მხარდაჭერა:ჩვენი ვალდებულება ვრცელდება პროექტის დასრულების მიღმა 3 თვის განმავლობაში გაყიდვის სერვისის პერიოდთან ერთად. ამ დროის განმავლობაში, ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომი შემდგომი, პრობლემების გადაჭრის დახმარებას და Q&A სესიებს, რომ მოგვმართოს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვა.
მომსახურების სპეციფიკაციები
| თანმიმდევრობის პლატფორმა | თანმიმდევრობის სტრატეგია | რეკომენდებულია მონაცემები | მონაცემთა ხარისხის კონტროლი |
| Illumina novaseq | PE150 | 12 გბ | Q30≥85% |
ნიმუშის მოთხოვნები
| კონცენტრაცია (ნგ/μl) | მთლიანი თანხა (μg) | მოცულობა (μl) | OD260/280 | OD260/230 | 9 |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
სამსახურის სამუშაო ნაკადი
ნიმუშის მიწოდება
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვების შემდეგ
მოიცავს შემდეგ ანალიზს:
● მონაცემთა ხარისხის კონტროლის თანმიმდევრობა
● ტრანსკრიპციის ასამბლეა
● ტაქსონომიური ანოტაცია და სიმრავლე
● ფუნქციური ანოტაცია და სიმრავლე
● გამოხატვის რაოდენობრივი და დიფერენციალური ანალიზი
თითოეული ნიმუშის ტაქსონომიური განაწილება:
ბეტა მრავალფეროვნების ანალიზი: UPGMA
ფუნქციური ანოტაცია - წადი სიმრავლე
დიფერენციალური ტაქსონომიის სიმრავლე - ლეფსი
გამოიკვლიეთ BMKGENE– ის მეტა ტრანსკრიპტომიკის თანმიმდევრობის სერვისების ხელშეწყობის წინსვლები პუბლიკაციების განკურნებული კოლექციის საშუალებით.
ლუ, ზ. და სხვ. (2023) 'მჟავა ტოლერანტობა წესრიგის ლაქტატით გამოყენებული ბაქტერიების ბაქტერიოიდალები ხელს უწყობს რუმინინოზის აციდოზის პრევენციას თხების დროს, რომელიც ადაპტირებულია მაღალი კონცენტრატის დიეტასთან',,ცხოველების კვება, 14, გვ. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
სიმღერა, Z. et al. (2017) 'ძირითადი ფუნქციური მიკრობიოტის ამოღება ტრადიციული მყარი მდგომარეობის ფერმენტაციაში მაღალი გამტარუნარიანობის ამპლიკონებითა და მეტატრანსკრიპტომიკის თანმიმდევრობით',საზღვრები მიკრობიოლოგიაში, 8 (ივლისი). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/სრული.
Wang, W. et al. (2022) 'რომანი მიკოვირუსები, რომლებიც აღმოჩენილია ფიტოპათოგენური ალტერნატივის სოკოების მეტატრანსკრიპტომიკის კვლევის შედეგად',ვირუსები, 14 (11), გვ. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
ვეი, ჯ. Et al. (2022) 'პარალელური მეტატრანსკრიპტული ანალიზი ცხადყოფს მცენარეთა მეორადი მეტაბოლიტების დეგრადაციას ხოჭოებითა და მათი ნაწლავის სიმბოლოებით',მოლეკულური ეკოლოგია, 31 (15), გვ 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.
