Long Non-coding Sequencing-Illumina
სერვისის უპირატესობები
●mRNA და lncRNA ერთობლივი ანალიზი: mRNA ტრანსკრიპტების რაოდენობრივი გაერთიანებით lncRNA და მათი სამიზნეების შესწავლით, შესაძლებელია მიიღოთ უჯრედული პასუხის საფუძვლად არსებული მარეგულირებელი მექანიზმის სიღრმისეული მიმოხილვა.
●ვრცელი ექსპერტიზა: ჩვენს გუნდს მოაქვს მდიდარი გამოცდილება ყველა პროექტში, BMK-ში 23000-ზე მეტი ნიმუშის დამუშავების გამოცდილება, რომელიც მოიცავს სხვადასხვა ტიპის ნიმუშებსა და lncRNA პროექტებს.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვნერგავთ ძირითად საკონტროლო წერტილებს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან დაწყებული თანმიმდევრობით და ბიოინფორმატიკით დამთავრებული. ეს ზედმიწევნითი მონიტორინგი უზრუნველყოფს თანმიმდევრულად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას.
●გაყიდვების შემდგომი მხარდაჭერა: ჩვენი ვალდებულება ვრცელდება პროექტის დასრულების ფარგლებს გარეთ 3 თვიანი გაყიდვის შემდგომი მომსახურების პერიოდით. ამ დროის განმავლობაში, ჩვენ ვთავაზობთ პროექტის შემდგომ დაკვირვებას, პრობლემების მოგვარების დახმარებას და კითხვა-პასუხის სესიებს, რათა მივმართოთ შედეგებთან დაკავშირებულ ნებისმიერ შეკითხვას.
ნიმუშის მოთხოვნები და მიწოდება
| ბიბლიოთეკა | პლატფორმა | რეკომენდებული მონაცემები | მონაცემთა QC |
| rRNA ამოწურული მიმართულების ბიბლიოთეკა | ილუმინა PE150 | 10-16 გბ | Q30≥85% |
ნუკლეოტიდები:
| კონს.(ნგ/მკლ) | რაოდენობა (მკგ) | სიწმინდე | მთლიანობა |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 გელზე ნაჩვენებია შეზღუდული ცილის ან დნმ-ის დაბინძურება ან არა. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; შეზღუდული ან არ არის საბაზისო სიმაღლე |
● მცენარეები:
ფესვი, ღერო ან ფურცელი: 450 მგ
ფოთოლი ან თესლი: 300 მგ
ხილი: 1,2გრ
● ცხოველი:
გული ან ნაწლავი: 450 მგ
შინაგანი ორგანოები ან ტვინი: 240 მგ
კუნთი: 600 მგ
ძვლები, თმა ან კანი: 1,5გრ
● ფეხსახსრიანები:
მწერები: 9გრ
კიბოსნაირნი: 450 მგ
● მთლიანი სისხლი:2 მილი
● უჯრედები: 106 უჯრედები
● შრატი და პლაზმა: 6 მლ
რეკომენდებული ნიმუშის მიწოდება
კონტეინერი: 2 მლ ცენტრიფუგის მილაკი (თუნუქის ფოლგა არ არის რეკომენდებული)
ნიმუშის მარკირება: ჯგუფი+რეპლიკა, მაგ. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
გადაზიდვა:
1. მშრალი ყინული: ნიმუშები უნდა იყოს შეფუთული ჩანთებში და დამარხული მშრალ ყინულში.
2. რნმ სტაბილური მილები: რნმ-ის ნიმუშები შეიძლება გაშრეს რნმ-ის სტაბილიზაციის მილში (მაგ. RNAstable®) და გაიგზავნოს ოთახის ტემპერატურაზე.
სერვისის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
რნმ-ის ექსტრაქცია
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვის შემდგომი მომსახურება
ბიოინფორმატიკა
დიფერენციალური გენის ექსპრესიის (DEGs) ანალიზი
lncRNA გამოხატვის რაოდენობრივი განსაზღვრა - კლასტერირება
lncRNA სამიზნე გენების გამდიდრება
ერთობლივი mRNA და lncRNA პოზიციის ანალიზი - ცირკოსის დიაგრამა (შუა წრე არის mRNA, ხოლო შიდა წრე არის lncRNA)
გამოიკვლიეთ მიღწევები, რაც ხელს უწყობს BMKGene-ის lncRNA თანმიმდევრობის სერვისებს პუბლიკაციების კურირებული კოლექციის მეშვეობით.
Ji, H. et al. (2020) „ვირთაგვების ღვიძლში სიცივის სტრესთან დაკავშირებული lncRNA-ების იდენტიფიკაცია, ფუნქციური პროგნოზირება და ძირითადი lncRNA გადამოწმება“, Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), გვ. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
ჯია, ზ. და სხვ. (2021) 'ინტეგრაციული ტრანსკრიპტომიური ანალიზი ავლენს იმუნურ მექანიზმს CyHV-3-რეზისტენტული ჩვეულებრივი კობრის შტამისთვის', Frontiers in Immunology, 12, გვ. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ და სხვ. (2022) 'მულტი-ომიკების ინტეგრაციაზე დაფუძნებული პრიორიტეტიზაცია კონკურენტი ენდოგენური რნმ-ის რეგულირების ქსელების მცირეუჯრედოვანი ფილტვის კიბოში: მოლეკულური მახასიათებლები და წამლების კანდიდატები', საზღვრები ონკოლოგიაში, 12, გვ. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. და სხვ. (2020) 'გენური თანაგამოხატვის ქსელის გენეტიკური დისექცია, რომელიც ეფუძნება ფოტოსინთეზს პოპულუსში', მცენარეთა ბიოტექნოლოგიის ჟურნალი, 18(4), გვ. 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
ჟენგი, ჰ. და სხვ. (2022) 'გლობალური მარეგულირებელი ქსელი დისრეგულირებული გენის გამოხატვისა და პათოლოგიური მეტაბოლური სიგნალიზაციისათვის იმუნურ უჯრედებში გრეივსის დაავადებისა და ჰაშიმოტოს თირეოიდიტის მიკროგარემოში', საზღვრები იმუნოლოგიაში, 13, გვ. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
