● ორი ეგზომელი პანელი, რომელიც ხელმისაწვდომია სამიზნე გამდიდრების საფუძველზე, გამოკვლევებით: დარწმუნდით, რომ შეარჩიეთ Human All Exon V6 (Agilent) და XGEN ეგზომო ჰიბრიდიზაციის პანელი V2 (IDT).
● თანმიმდევრობა Illumina Novaseq– ზე.
● ბიოინფორმატული მილსადენი, რომელიც მიმართულია დაავადების ანალიზის ან სიმსივნის ანალიზისკენ.
●სამიზნეების ცილების კოდირების რეგიონი: ცილის კოდირების რეგიონების აღების და თანმიმდევრობით, HWES გამოიყენება ცილის სტრუქტურასთან დაკავშირებული ვარიანტების გამოსავლენად.
●ეფექტური:HWES იძლევა ადამიანის დაავადებასთან დაკავშირებული მუტაციების დაახლოებით 85% ადამიანის გენომის 1% -ს.
●მაღალი სიზუსტე: მაღალი თანმიმდევრობის სიღრმით, HWES ხელს უწყობს როგორც საერთო ვარიანტების გამოვლენას, ასევე იშვიათ ვარიანტებს, რომელთა სიხშირე 1%-ზე ნაკლებია.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვასრულებთ ხუთი ძირითადი საკონტროლო წერტილს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან თანმიმდევრობით და ბიოინფორმატიკით. ეს დეტალური მონიტორინგი უზრუნველყოფს თანმიმდევრულად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას.
●ყოვლისმომცველი ბიოინფორმატიკის ანალიზი: ჩვენი მილსადენი სცილდება საცნობარო გენომის ცვალებადობის იდენტიფიცირებას, რადგან იგი მოიცავს მოწინავე ანალიზს, რომელიც შექმნილია კვლევის კითხვებზე, რომლებიც დაკავშირებულია დაავადებების ან სიმსივნის ანალიზთან დაკავშირებული კვლევითი ასპექტებთან.
●გაყიდვების მხარდაჭერა:ჩვენი ვალდებულება ვრცელდება პროექტის დასრულების მიღმა 3 თვის განმავლობაში გაყიდვის სერვისის პერიოდთან ერთად. ამ დროის განმავლობაში, ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომი შემდგომი, პრობლემების გადაჭრის დახმარებას და Q&A სესიებს, რომ მოგვმართოს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვა.
Exon Capture სტრატეგია | თანმიმდევრობის სტრატეგია | რეკომენდებულია მონაცემთა გამომუშავება |
დარწმუნდით, რომ აირჩიეთ Human All Exon V6 (Agilent) ან XGEN ეგზომო ჰიბრიდიზაციის პანელი V2 (IDT)
| Illumina novaseq PE150 | 5 -10 GB მენდელიის დარღვევებისთვის/იშვიათი დაავადებების გამო:> 50x სიმსივნის ნიმუშებისთვის: ≥ 100x |
ნიმუშის ტიპი
| თანხა(Qubit®)
| კონცენტრაცია | ტომი
| სიწმინდე (Nanodrop ™) |
გენომი დნმ
| ≥ 50 ნგ | ≥ 6 ნგ/μl | ≥ 15 μl | OD260/280 = 1.8-2.0 არ არის დეგრადაცია, დაბინძურება
|
HWES- დისიზის ნიმუშების ბიოინფორმაციული ანალიზი მოიცავს:
● მონაცემების თანმიმდევრობა QC
● მითითების გენომის გასწორება
Snps და ინდელის იდენტიფიცირება
Snps და ინდელის ფუნქციური ანოტაცია
სიმსივნის ნიმუშების ბიოინფორმაციული ანალიზი მოიცავს:
● მონაცემების თანმიმდევრობა QC
● მითითების გენომის გასწორება
SNP- ების, ინდლებისა და სომატური ვარიაციების იდენტიფიცირება
Germin ხაზის ვარიანტების იდენტიფიცირება
● მუტაციის ხელმოწერების ანალიზი
Drive წამყვანი გენების იდენტიფიცირება ფუნქციონირების მომატების მუტაციებზე დაყრდნობით
● მუტაციის ანოტაცია წამლის მგრძნობელობის დონეზე
● ჰეტეროგენურობის ანალიზი - სიწმინდისა და პლოიდიის გაანგარიშება
მონაცემები QC - ეგზომების დაჭერის სტატისტიკა
ვარიანტის იდენტიფიკაცია - INDELS
მოწინავე ანალიზი: მავნე SNP/INDELS- ის იდენტიფიკაცია და განაწილება - Circos ნაკვეთი
სიმსივნის ანალიზი: სომატური მუტაციების იდენტიფიკაცია და განაწილება - Circos ნაკვეთი
სიმსივნის ანალიზი: კლონური ხაზები