ევკარიოტული mRNA თანმიმდევრობა-NGS
თვისებები
● პოლი mRNA- ს ხელში ჩაგდება ბიბლიოთეკის მომზადებამდე
● არჩევითი მიმართულების mRNA ბიბლიოთეკის მომზადება, რათა მოხდეს სტრიქონის სპეციფიკური თანმიმდევრობის მონაცემების მოპოვება
● გენის გამოხატვისა და ტრანსკრიპციის სტრუქტურის ბიოინფორმაციული ანალიზი
უპირატესობები
●ფართო ექსპერტიზაჩვენს გუნდმა დაამუშავა 600,000 -ზე მეტი ნიმუში Bmkgene- ში, რომელიც მოიცავს მრავალფეროვან ნიმუშებს, როგორიცაა უჯრედების კულტურები, ქსოვილები და სხეულის სითხეები. ჩვენ ყველა პროექტს ვატარებთ უამრავ გამოცდილებას და წარმატებით დავამთავრეთ 100,000-ზე მეტი mRNA-seq პროექტი სხვადასხვა კვლევის სფეროში.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვასრულებთ ძირითადი საკონტროლო წერტილებს ყველა ეტაპზე, ნიმუშისა და ბიბლიოთეკის მომზადებიდან თანმიმდევრობით და ბიოინფორმატიკით. ეს ზედმიწევნით მონიტორინგი უზრუნველყოფს თანმიმდევრულად მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდებას, რაც გარწმუნებთ, რომ თქვენი პროექტი საიმედო ხელშია.
●ყოვლისმომცველი ანოტაცია: ჩვენ ვიყენებთ მრავალჯერადი მონაცემთა ბაზას, რომ ფუნქციურად ანოტაცია მოახდინონ განსხვავებულად გამოხატული გენების (DEGs) და შესაბამისი გამდიდრების ანალიზების შესასრულებლად. ეს ყოვლისმომცველი მიდგომა იძლევა იმის გარკვევას უჯრედულ და მოლეკულურ პროცესებზე, რომლებიც ემყარება ტრანსკრიპციულ პასუხს, რაც უზრუნველყოფს თქვენი პროექტის შედეგების სრულად ინფორმირებას.
●გაყიდვების მხარდაჭერა: ჩვენი ვალდებულება ვრცელდება პროექტის დასრულების მიღმა, 3 თვიანი გაყიდვის სერვისის პერიოდის განმავლობაში. ამ დროის განმავლობაში, ჩვენ გთავაზობთ პროექტის შემდგომი შემდგომი, პრობლემების გადაჭრის დახმარებას და Q&A სესიებს, რომ მოგვმართოს შედეგებთან დაკავშირებული ნებისმიერი შეკითხვა.
ნიმუშის მოთხოვნები და მიწოდება
| ბიბლიოთეკა | თანმიმდევრობის სტრატეგია | რეკომენდებულია მონაცემები | ხარისხის კონტროლი |
| პოლი გამდიდრებული | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
ნიმუშის მოთხოვნები:
ნუკლეოტიდები:
| Conc. (ნგ/μl) | თანხა (μg) | სიწმინდე | პატიოსნება | |
| სტანდარტული ბიბლიოთეკა | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 გელზე ნაჩვენები ცილის ან დნმ -ის დაბინძურება. | მცენარეებისთვის: rin≥4.0; ცხოველებისთვის: Rin≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; შეზღუდული ან საწყისი საწყისი სიმაღლე |
| მიმართულების ბიბლიოთეკა | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 გელზე ნაჩვენები ცილის ან დნმ -ის დაბინძურება. | მცენარეებისთვის: rin≥4.0; ცხოველებისთვის: Rin≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; შეზღუდული ან საწყისი საწყისი სიმაღლე |
● მცენარეები:
ფესვი, ღეროვანი ან ფურცელი: 450 მგ
ფოთოლი ან თესლი: 300 მგ
ხილი: 1.2 გ
●ცხოველი:
გული ან ნაწლავი: 300 მგ
ვისცერა ან ტვინი: 240 მგ
კუნთი: 450 მგ
ძვლები, თმა ან კანი: 1 გ
● ართროპოდები:
მწერები: 6 გ
Crustacea: 300 მგ
● მთელი სისხლი: 1 მილის
● უჯრედები: 106 უჯრედები
რეკომენდებული ნიმუშის მიწოდება
კონტეინერი: 2 მლ ცენტრიფუგის მილის (კალის კილიტა არ არის რეკომენდებული)
ნიმუშის ეტიკეტირება: ჯგუფი+განმეორება EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
გადაზიდვა:
1. მშრალი ყინა: ნიმუშები უნდა შეფუთონ ჩანთებში და დაკრძალონ მშრალ ყინულებში.
2. RNAS მაგიდის მილები: RNA ნიმუშები შეიძლება გამხმარი იყოს RNA სტაბილიზაციის მილში (მაგ. RNastable®) და გაიგზავნება ოთახის ტემპერატურაზე.
სამსახურის სამუშაო ნაკადი
ექსპერიმენტის დიზაინი
ნიმუშის მიწოდება
რნმ -ის მოპოვება
ბიბლიოთეკის მშენებლობა
თანმიმდევრობა
მონაცემთა ანალიზი
გაყიდვების შემდეგ
ბიოინფორმატიკა
ევკარიოტული mRNA თანმიმდევრობის ანალიზის სამუშაო ნაკადი
ბიოინფორმატიკა
Øნედლი მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
Øსაცნობარო გენომის გასწორება
Øტრანსკრიპციის სტრუქტურის ანალიზი
Øგამოხატვის რაოდენობრივი მაჩვენებელი
Øდიფერენციალური გამოხატვის ანალიზი
Øფუნქციის ანოტაცია და გამდიდრება
საცნობარო გენომის გასწორება
მონაცემთა გაჯერება
ნიმუშის კორელაცია და ბიოლოგიური რეპლიკების შეფასება
განსხვავებულად გამოხატული გენები (DEGS)
DEG– ების ფუნქციური ანოტაცია
DEG– ების ფუნქციური გამდიდრება
გამოიკვლიეთ BMKGENE- ის ევკარიოტული NGS mRNA თანმიმდევრობის სერვისების ხელშეწყობის წინსვლები პუბლიკაციების კურდღელი კოლექციის საშუალებით.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan და Triclocarban ასუსტებენ ოქროს თევზის სუნიანი სიმძლავრეს სუნის აღიარების შეზღუდვით, ყნოსვითი სიგნალის გადაცემის შეფერხებით და ინფორმაციის დამუშავების უნარ -ჩვევების გადაცემის შეფერხებით', წყლის კვლევა, 233, გვ. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
ჯია, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus hesting ადამიანის p11 სოკოვანი შემცველი ფაგოსომების გადამისამართება არა კოდირებულ გზაზე', უჯრედის მასპინძელი და მიკრობი, 31 (3), გვ. 373-388.e10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
ჯინი, კ. Et al. (2022) 'TCP ტრანსკრიპციის ფაქტორები, რომლებიც მონაწილეობენ MA ბამბუკის სროლის განვითარებაში (Dendrocalamus latiflorus munro)', საზღვრები მცენარეთა მეცნიერებაში, 13, გვ. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/Bibtex.
Wen, X. et al. (2022) 'Chrysanthemum lavandulifolium genome და მოლეკულური მექანიზმი, რომელიც მოიცავს მრავალფეროვან კაპიტულურ ტიპებს', მებაღეობის კვლევა, 9. Doi: 10.1093/სთ/UHAB022.
ჟანგი, იუჯი და სხვ. (2023) 'კასკადური ნანორექტორის სონოდინამიკური თერაპიის გასაუმჯობესებლად კოლორექტალურ კიბოზე სინერგიული ROS- ის დამატებით და ავტოფაგიის ბლოკირების გზით ", ნანო დღეს, 49, გვ. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
