Illumina-ს წინასწარ დამზადებული ბიბლიოთეკები
მახასიათებლები
●პლატფორმები:Illumina NovaSeq 6000 და NovaSeq X Plus
●თანმიმდევრობის რეჟიმები:PE150 და PE250
●ბიბლიოთეკების ხარისხის კონტროლი თანმიმდევრობამდე
●მონაცემთა QC და მიწოდების თანმიმდევრობა:QC ანგარიშის და ნედლი მონაცემების მიწოდება fastq ფორმატში დემულტიპლექსირებისა და Q30 წაკითხვის გაფილტვრის შემდეგ
სერვისის უპირატესობები
●თანმიმდევრობის სერვისების მრავალფეროვნება:მომხმარებელს შეუძლია აირჩიოს თანმიმდევრობა ზოლის, ნაკადის უჯრედის ან საჭირო მონაცემების მიხედვით (ნაწილობრივი ზოლის თანმიმდევრობა).
●დიდი გამოცდილება Illumina-ს თანმიმდევრობის პლატფორმაზე:ათასობით დახურული პროექტით სხვადასხვა სახეობებით.
●თანმიმდევრობის QC ანგარიშის მიწოდება:ხარისხის მეტრიკებით, მონაცემთა სიზუსტით და თანმიმდევრობის პროექტის საერთო შესრულებით.
●სექსუალური თანმიმდევრობის პროცესი:შემობრუნების მოკლე დროით.
●მკაცრი ხარისხის კონტროლი: ჩვენ ვახორციელებთ მკაცრ QC მოთხოვნებს, რათა გარანტირებული იყოს მუდმივი მაღალი ხარისხის შედეგების მიწოდება.
პლატფორმების ნიმუში
| პლატფორმა | ნაკადის უჯრედი | თანმიმდევრობის რეჟიმი | ერთეული | სავარაუდო გამომავალი |
| NovaSeq X | 10B (8 ზოლი) | PE150 | ერთი შესახვევი ნაწილობრივი შესახვევი | 375 გბ / შესახვევი |
| 25B (8 ზოლი) | PE150 | ერთი შესახვევი ნაწილობრივი შესახვევი | 1000 გბ/ჩიხი | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow cell (2 ზოლი) | PE250 | ნაკადის უჯრედი ერთი შესახვევი ნაწილობრივი შესახვევი | 325-400 მ კითხულობს / შესახვევი |
| S4 ნაკადის უჯრედი (4 ზოლი) | PE150 | ნაკადის უჯრედი ერთი შესახვევი ნაწილობრივი შესახვევი | ~ 800 გბ / შესახვევი |
ნიმუშის მოთხოვნები
| მონაცემთა რაოდენობა (X) | კონცენტრაცია (qPCR/nM) | მოცულობა | |
| ზოლის ნაწილობრივი თანმიმდევრობა
| X ≤ 10 გბ | ≥ 1 ნმ | ≥ 25 მლ |
| 10 გბ < X ≤ 50 გბ | ≥ 2 ნმ | ≥ 25 მლ | |
| 50 გბ < X ≤ 100 გბ | ≥ 3 ნმ | ≥ 25 მლ | |
| X > 100 გბ | ≥ 4 ნმ | ≥ 25 მლ | |
| ზოლის თანმიმდევრობა | პერ ლეინზე | ≥ 1,5 ნმ / ბიბლიოთეკის აუზი | ≥ 25 μl / ბიბლიოთეკის აუზი |
გარდა კონცენტრაციისა და მთლიანი ოდენობისა, საჭიროა შესაბამისი პიკის ნიმუშიც.
შენიშვნა: დაბალი მრავალფეროვნების ბიბლიოთეკების ზოლის თანმიმდევრობა მოითხოვს PhiX-ის სპაიკ-ინს, რათა უზრუნველყოს ძლიერი ბაზის გამოძახება.
ჩვენ გირჩევთ წარადგინოთ წინასწარ გაერთიანებული ბიბლიოთეკები ნიმუშებად. თუ გჭირდებათ BMKGENE ბიბლიოთეკის გაერთიანების შესასრულებლად, გთხოვთ, იხილოთ
ბიბლიოთეკის მოთხოვნები ნაწილობრივი ზოლის მიმდევრობისთვის.
ბიბლიოთეკის ზომა (პიკის რუკა)
ძირითადი პიკი უნდა იყოს 300-450 bp ფარგლებში.
ბიბლიოთეკებს უნდა ჰქონდეთ ერთი მთავარი პიკი, ადაპტერის დაბინძურება და პრაიმერის დიმერები.
გთხოვთ, დაგვიკავშირდეთ, თუ თქვენი ნიმუშები არ აკმაყოფილებს საწყისი მასალის მოთხოვნებს.
სერვისის სამუშაო პროცესი
ბიბლიოთეკის ხარისხის კონტროლი
თანმიმდევრობა
მონაცემთა ხარისხის კონტროლი
პროექტის მიწოდება
ბიბლიოთეკის QC ანგარიში
ბიბლიოთეკის ხარისხის ანგარიში მოწოდებულია თანმიმდევრობით, ბიბლიოთეკის რაოდენობისა და ფრაგმენტაციის შეფასებამდე.
QC ანგარიშის თანმიმდევრობა
ცხრილი 1. მონაცემების თანმიმდევრობის სტატისტიკა.
| ნიმუში ID | BMKID | ნედლი კითხულობს | ნედლეული მონაცემები (bp) | სუფთა წაკითხვები (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
სურათი 1. ხარისხის განაწილება წაკითხვის გასწვრივ თითოეულ ნიმუშში
სურათი 2. საბაზისო შინაარსის განაწილება
სურათი 3. წაკითხული შიგთავსის განაწილება თანმიმდევრულ მონაცემებში
