ამპლიკონის თანმიმდევრობა (16S/18S/ITS)

ამპლიკონის (16S/18S/ITS) თანმიმდევრობა Illumina-ით არის მიკრობული მრავალფეროვნების ანალიზის მეთოდი მიკრობული პროფილების მათი თანმიმდევრობის მიხედვით და შემდეგ საზოგადოების სიმდიდრისა და მრავალფეროვნების გაშიფვრის მცდელობით თითოეულ ნიმუშში და ნიმუშებს შორის. BMKCloud Amplicon (NGS) მილსადენი იძლევა 16S, 18S, ITS და მრავალი ფუნქციური გენის ანალიზს. ის იწყება წაკითხვის მოჭრით, დაწყვილებული ბოლო წაკითხვის შეკრებით და ხარისხის შეფასებით, რასაც მოჰყვება მსგავსი წაკითხვის კლასტერირება ოპერაციული ტაქსონომიური ერთეულების (OTUs) გენერირებით, რომლებიც გამოიყენება ექვს სხვადასხვა საანალიზო სექციაში. ტაქსონომიური ანოტაცია გვაწვდის ინფორმაციას თითოეული ნიმუშის შედარებით სიმრავლისა და შემადგენლობის შესახებ, ხოლო ალფა და ბეტა მრავალფეროვნების ანალიზები ფოკუსირებულია მიკრობული მრავალფეროვნებაზე ნიმუშებში და ნიმუშებს შორის, შესაბამისად. ჯგუფებს შორის დიფერენციალური ანალიზი აღმოაჩენს OTU-ებს, რომლებიც განსხვავდებიან პარამეტრული და არაპარამეტრული ტესტების გამოყენებით, ხოლო კორელაციური ანალიზი ამ განსხვავებებს აკავშირებს გარემო ფაქტორებთან. დაბოლოს, გენის ფუნქციური სიმრავლე პროგნოზირებულია მარკერის გენის სიმრავლის საფუძველზე, რაც უზრუნველყოფს თითოეულ ნიმუშში ფუნქციის და ეკოლოგიის ხედვას.