● Pustaka dobel kanggo ngurutake transkriptom lengkap: penipisan rRNA diikuti persiapan perpustakaan PE150 lan pilihan ukuran diikuti persiapan perpustakaan SE50
● Analisis bioinformatika lengkap mRNA, lncRNA, circRNA, lan miRNA ing laporan bioinformatika sing kapisah
● Analisis gabungan kabeh ekspresi RNA ing laporan gabungan, kalebu analisis jaringan ceRNA.
●Analisis jero Jaringan Regulasi: Analisis jaringan ceRNA diaktifake kanthi urutan gabungan mRNA, lncRNA, circRNA, lan miRNA lan kanthi alur kerja bioinformatik sing lengkap.
●Anotasi Komprehensif: Kita nggunakake macem-macem basis data kanggo menehi anotasi fungsional ing Differentially Expressed Genes (DEGs) lan nindakake analisis pengayaan sing cocog, nyedhiyakake wawasan babagan proses seluler lan molekuler sing ndasari respon transkriptom.
●Keahlian ekstensif: Kanthi rekaman trek sing sukses nutup luwih saka 2100 kabeh proyek transkrip ing macem-macem domain riset, tim kita nggawa akeh pengalaman kanggo saben proyek.
●Kontrol Kualitas sing ketat: Kita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, saka persiapan sampel lan perpustakaan nganti urutan lan bioinformatika. Pemantauan sing tliti iki njamin asil kualitas sing terus-terusan.
●Dhukungan Post-Sales: Komitmen kita ngluwihi proyek rampung kanthi wektu layanan sawise-sale 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, pitulungan ngatasi masalah, lan sesi Q&A kanggo ngatasi pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
Pustaka | Strategi urutan | Data dianjurake | Kontrol kualitas |
rRNA entek | Illumina PE 150 Kab | 16 Gb | Q30≥85% |
Ukuran dipilih | Illumina SE50 Kab | 10-20M diwaca |
Nukleotida:
Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; winates utawa ora elevasi baseline |
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (Timah foil ora dianjurake)
Labeling sampel: Group+replikat contone A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Kintunan:
1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing tas lan dikubur ing es garing.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (umpamane RNAstable®) lan dikirim ing suhu kamar.
Bioinformatika
Ringkesan ekspresi RNA
Gen sing diungkapake kanthi beda
analisis ceRNA
Jelajahi kemajuan riset sing difasilitasi dening layanan urutan transkriptom kabeh BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.
Dai, Y. et al. (2022) 'Profil ekspresi komprehensif mRNA, lncRNA lan miRNA ing penyakit Kashin-Beck sing diidentifikasi kanthi urutan RNA', Molecular Omics, 18(2), pp. 154-166. doi: 10.1039 / D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'Analisis transkriptom lengkap babagan resistensi kadhemen Apis cerana ing Gunung Changbai sajrone mangsa overwintering.', Gene, 830, pp. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritisasi Berbasis Integrasi Multi-Omics saka Jaringan Regulasi RNA Endogen sing Saingan ing Kanker Paru-paru Sel Cilik: Karakteristik Molekul lan Calon Narkoba', Frontiers ing Onkologi, 12, p. 904865. doi: 10.3389 / FONC.2022.904865 / BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) 'Analisis terintegrasi profil ekspresi lncRNA / circRNA-miRNA-mRNA mbukak wawasan novel babagan mekanisme potensial kanggo nanggepi nematoda akar-simpul ing kacang', BMC Genomics, 23 (1), pp. 1-12. doi: 10.1186 / S12864-022-08470-3 / GAMBAR / 7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Urutan RNA transkrip kabeh nyorot mekanisme molekuler sing ana gandhengane karo pangopènan kualitas pascapanen ing brokoli kanthi iradiasi LED abang', Biologi lan Teknologi Pasca Panen, 188, p. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.