Kabeh Genome Bisul Fi Te Sequencing (WGBS)
Sequencing Bisulfite Genome kabeh (WGBS) minangka metodologi emas-standar saka eksplorasi jero saka cytosine (5-MC), peraturan pangumilake gen lan kegiatan mRNA. Prinsip ndasari WGB ndherek perawatan bisulfite, nyurung konversi cytosines Unmethylated menyang Uracil (c nganti u), nalika ninggalake Siktosing Methylated ora owah. Teknik iki nyedhiyakake resolusi siji-siji, saéngga peneliti kanthi lengkap kanggo nyelidiki metylome metylome lan nemokake pola methilome sing ora normal sing ana gandhengane karo macem-macem kahanan, mula kanker. Kanthi nggunakake WGBS, para ilmuwan bisa entuk pemahaman sing ora cocog dadi tentrem metilitas genome sing beda-beda, nyedhiyakake pangerten sing ora dirusak saka mekanisme epigenetik sing ana macem-macem proses lan penyakit biologis.
Fitur Layanan
● Perlu genome referensi.
● DNA Lambda ditambahake kanggo ngawasi efisiensi konversi bisulfite.
● Sequencing on sallumina novaseq.
Keuntungan Layanan
●Standar emas kanggo riset metilasi DNA: Teknologi pangolahan konektor konversi sing diwasa iki nduweni akurasi dhuwur lan reproducibility apik.
●Resolusi jangkoan lan resolusi siji:Deteksi situs metilasi ing tingkat genom sing akeh.
●Platform lengkap:Nyedhiyani layanan sing apik kanggo ngolah sampel saka pangolahan sampel, konstruksi perpustakaan, urutan kanggo analisis bioinformatics.
●Keahlian ekstensif: Kanthi proyek urutan WGBs sukses ing macem-macem spesies, Bmkgene nggawa pengalaman dekade, tim analisis sing trampil, konten sing lengkap, lan dhukungan pasca sing lengkap.
●Kemungkinan kanggo gabung karo analisis transcriptomics: Ngidini analisis terpadu WGB karo data omoik liyane kayata RNA-SEQ.
Conto conto
| Perpustakaan | Strategi Sequencing | Output data sing disaranake | Kontrol Kualitas |
| Bisulfite diobati | Illumina PE150 | 30x ambane | Q30 ≥ 85% Konversi Bisulfite> 99% |
Syarat conto
| Konsentrasi (ng / μL) | Jumlah (μg) | Syarat tambahan | |
| DNA Genomic | ≥ 5 | ≥ 400 Ng | Dogradasi winates utawa kontaminasi winates |
Aliran kerja layanan
Pangiriman Contoh
Extraction DNA
Konstruksi Perpustakaan
Urutan
Analisis Data
Pangiriman Data
Kalebu analisis ing ngisor iki:
● Kontrol kualitas urut;
● Pemetaan kanggo referensi genome;
● Deteksi 5mc Methyllated dhasar;
● Analisis distribusi metylasi lan annotasi;
● Analisis wilayah sing beda-beda metylated (DMRS);
● Annotasi fungsi gen sing ana gandhengane karo DMR.
5mc Methylation Deteksi: Jinis Situs Methylated
Peta Methilation. 5MC metilasi distribusi sudhut genome
Annotasi wilayah sing apik banget
Wilayah sing beda-beda metylated: gen sing digandhengake
Wilayah sing beda-beda mety: annotasi gen (ontologi gene)
Jelajahi kemajuan riset sing digampangake dening layanan urut urutan bisulfite genome Bmkgene kanthi nggunakake publications publikasi sing curated.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analisis profil DNA metleylation sajrone pangembangan otot balung nggunakake pangembangan otot otot kanthi nggunakake urutan bisulfite-genfiteGenomik BMC, 21 (1), pp. 1-15. DOI: 10.1186 / s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Novel Deoxyribontucleic Methylication Methylicy Perturbations in buruh sing kapapar vinyl klorida',Toksikologi lan kesehatan industri, 38 (7), PP. 377-388. DOI: 10.1177 / 07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'hubungan antara metilasi genome, tingkat non-coding rnas, mrnas lan metabolit ing woh-wohan tomat sing ripening',Jurnal Tanduran, 103 (3), PP. 980-994. DOI: 10,111 / tpj.14778.
