Cilik RNA Sequencing-Illumina
Fitur
● Persiapan perpustakaan kalebu langkah pilihan ukuran
● Analisis bioinformatika sing dipusatake ing prediksi miRNA lan targete
Kaluwihan Service
●Analisis bioinformatika sing komprehensif:Ngaktifake identifikasi miRNA sing dikenal lan novel, identifikasi target miRNA, lan anotasi fungsional lan pengayaan sing cocog karo macem-macem database (KEGG, GO)
●Kontrol Kualitas sing ketat: Kita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, saka persiapan sampel lan perpustakaan nganti urutan lan bioinformatika. Pemantauan sing tliti iki njamin asil kualitas sing terus-terusan.
●Dhukungan Post-Sales: Komitmen kita ngluwihi proyek rampung kanthi wektu layanan sawise-sale 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, pitulungan ngatasi masalah, lan sesi Q&A kanggo ngatasi pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
●Keahlian ekstensif: Kanthi rekaman trek sing sukses nutup pirang-pirang proyek sRNA sing nyakup luwih saka 300 spesies ing macem-macem domain riset, tim kita nggawa akeh pengalaman kanggo saben proyek.
Syarat Sampel lan Pangiriman
| Pustaka | Platform | Data sing disaranake | Data QC |
| Ukuran dipilih | Illumina SE50 Kab | 10M-20M diwaca | Q30≥85% |
Syarat Sampel:
Nukleotida:
| Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; winates utawa ora elevasi baseline |
● Tanduran:
ROOT, Batang utawa Petal: 450 mg
Godhong utawa Wiji: 300 mg
Woh: 1,2 g
● Kewan:
Jantung utawa Usus: 450 mg
Viscera utawa Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Balung, Rambut utawa Kulit: 1,5g
● Artropoda:
serangga: 9 g
Crustacea: 450 mg
● Getih wutuh: 2 tub
● Sel: 106 sel
● Serum lan Plasma:6 ml
Pangiriman Sampel sing Disaranake
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (Timah foil ora dianjurake)
Labeling sampel: Group+replikat contone A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Kintunan:
1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing tas lan dikubur ing es garing.
2. Tabung RNAstable: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (umpamane RNAstable®) lan dikirim ing suhu kamar.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
pangiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Layanan sawise-sale
Bioinformatika
● Kontrol kualitas data mentah
● klasifikasi sRNA
● Alignment menyang génom referensi
● Identifikasi miRNA sing dikenal lan novel
● Analisis ekspresi miRNA diferensial
● Anotasi fungsional target miRNA
Identifikasi miRNA: struktur lan ambane
Ekspresi diferensial miRNA - clustering hiearchical
Anotasi fungsional saka target miRNA sing ditulis kanthi beda
Jelajahi kemajuan riset sing difasilitasi dening layanan urutan sRNA BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.
Chen, H. et al. (2023) 'Infeksi virus nyandhet biosintesis saponin lan fotosintesis ing Panax notoginseng', Fisiologi Tumbuhan lan Biokimia, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Tanduran FYVE domain sing ngemot protein FREE1 digandhengake karo komponen mikroprosesor kanggo nyegah biogenesis miRNA', laporan EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p Ngontrol Perkembangan Pupal Larva kanthi Nargetake Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) ing Lebah Madu, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p . 5726. doi: 10.3390 / IJMS24065726 / S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analisis Terpadu MiRNA lan Gen sing Digandhengake karo Kualitas Daging Ngandhakake yen Gga-MiR-140-5p Ngaruhi Deposisi Lemak Intramuskular ing Pitik', Fisiologi Seluler lan Biokimia, 46 (6), pp. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
