Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud Mlebu

Produk

Urutan tunggal- Nuklélai RNA

Perkembangan teknik cadangan tunggal lan teknik konstruksi perpustakaan khusus, ditambah karo urutan overput dhuwur, wis sinau ekspresi gen gen ing tingkat sel. Pecretthrough iki ngidini kanggo analisis populasi sel sing luwih jero lan luwih lengkap, ngatasi watesan sing ana gandhengane karo ekspresi gen sing ana ing kabeh sel lan njaga heterogenitas sing sejati. Dene urutan RNA sel-sel (Scrna-SEQ) duwe kaluwihan sing ora bisa ditolak, nemoni tantangan ing jaringan tartamtu ing endi penjual sundel siji-sel sing angel lan mbutuhake conto seger. Ing Bmkgene, kita ngrampungake rintangan iki kanthi nawakake urutan RNA-nukleus (SNRNA-SEQ) nggunakake teknologi Chromium Genomic State-of-the-Art. Pendhaftaran pendekatan iki nyebar spektrum conto sing bisa dianalisis kanggo analisis transcriptome ing tingkat sel siji-sel.

Pengasingan inti wis rampung liwat 10X Chip Chromium Genomics 10x Inovative, nampilake sistem mikrofluidika wolung saluran kanthi nyebrang kaping pindho. Ing sistem iki, manik-manik gel sing nggabungake barcodes, primer, enzim, lan inzim tunggal dikencengi ing irisan minyak ukuran nanoliter, mbentuk belis-emulsion (permata). Dipuntedahaken gem pembentukan, lysis sel lan barkod dumadi ing saben permata. Sabanjure, molekul MRNA ngalami transkrip maneh menyang Cdnas, nggabungake bolong 10x lan pengenal molekuler sing unik (umis). Cdnas iki banjur kena ing konstruksi perprestian sing terus-terusan, nggampangake eksplorasi profil ekspresi gen ing level siji-sel.

Platform: 10 × Platform Genomics Chromium lan Platform Illumina Novaseq

Hubungi kita

Rincian Layanan

Bioinformatics

Demo asil

Publications sing ditampilake

Skema Teknikal

Pengasingan inti diraih nganti 10 × Sistem Genomic ×, sing kalebu sistem microfluidics wolung saluran kanthi nyabrang dobel. Ing sistem iki, manik-manik gel karo barcode lan primer, enzim lan inti tunggal yaiku encapsulated ing lenga minyak ukuran nanoliter-in-emulition (permata). Sawise permata dibentuk, sel lysis lan ngeculake barcodes ditindakake ing saben permata. MRNA reparsa diterusake menyang molekul CDNA kanthi 10 × BARCODES lan UMI, sing luwih tundhuk karo konsultasi perprestah perpustakaan standar.

Fitur

● Preparation penundaan tunggal-inuktif saka jaringan beku

● pembentukan gel manik-in-emulsion (permata) sing diikuti karo sintesis CDNA

● Saben manik ing permata dimuat karo primer dumadi saka 4 bagean:

Buntut Poly (DT) kanggo Sintesis MRNA,

Pengenal molekir unik (UMI) kanggo mbenerake bias amplifikasi

10x BARCOGE

Urutan naleni saka sebagean maca 1 SEquencing Primer

Keuntungan

Sequencing RNA-nukleus Spreivers Cirge Watesan RNA-sel RNA tunggal, Ngaktifake:

● Panganggone conto conto beku lan ora mung diwatesi kanggo conto seger

● kurang saka sel beku sing kurang yen dibandhingake perawatan enzim ing sel seger, dibayangke ing data transkriptome ing bentuk gen sing kurang stres

● Ora perlu sadurunge mbusak sel getih abang

● diameter cell tanpa watesan

● Gedhe jumlah conto sing layak kanggo analisa, kalebu jinis jaringan kompleks lan ringkih sing rawan kanggo clumping cell utawa karusakan nalika jaringan dissociation

Sampel sing ora bisa dianalisa dening urutan RNA sel siji lan layak kanggo urutan tunggal inti:

Cell / Tissue	Alesan
Unfresh jaringan beku	Ora bisa entuk organisasi sing seger utawa dawa
Sel Otot, MegakaroCyte, Lemak ...	Diameter sel amba banget kanggo mlebu instrumen kasebut
Ati ...	Ringkes banget kanggo ngilangi, ora bisa mbedakake sel siji
Sel Neuron, Otak ...	Luwih sensitif, gampang stres, bakal ngganti asil urutan
Pancreas, Tiroid ...	Sugih enzim endogenous, sing mengaruhi produksi penundaan sel siji

Tunggal-inuktri vs siji-sel

Tunggal-inti	Sel siji-sel
Diameter sel tanpa watesan	Diameter Sel: 10-40 μm
Bahan bisa dadi jaringan beku	Bahan kasebut kudu dadi jaringan seger
Stres kurang saka sel beku	Perawatan enzim bisa nyebabake reaksi stres sel
Ora ana sel getih abang sing kudu dicopot	Sel getih abang kudu dicopot
Nuklir nyatakake bioinformasi	Seltone sel nuduhake bioinformasi

Spesifikasi

Syarat conto

Perpustakaan

Strategi Sequencing

Data Disaranake

Kontrol Kualitas

Jaringan kewan ≥ 200 mg

Jaringan tanduran ≥ 400 mg

10x Genomics SN CDNA Pustaka

Illumina PE150

100k PE maca saben sel

(100-200 GB)

700-1200 inti / μL lan integritas Nuklei diamati ing mikroskop

Kanggo katrangan lengkap babagan tuntunan persiapan lan alur kerja persiyapan, mangga bebas ngobrol karo aBmkgene ahli

Aliran kerja layanan

Sadurunge: Tanduran / Kewan Genom Genome Sequencing

Sabanjure: Analisis Asosiasi Genome-Wide

Kalebu analisis ing ngisor iki:

● Kontrol Kualitas: Nomer sel, deteksi gen, identifikasi sel akurat, molekul rna lan kuantifitas ekspresi

● Analisis sampel njero:

Cell Clustering lan Sonotasi Kluster

Analisis ekspresi diferensial: identifikasi degs ing kluster

Annotasi fungsi lan pengeluaran kluster degs

● Analisis antarmer-grup:

Kombinasi data

Analisis ekspresi diferensial: identifikasi degs ing kelompok

Annotasi fungsi lan pengeluaran klompok degs

● Analisis majeng:

Analisis Siklus Sel

Analisis pseudotime

Analisis komunikasi sel (ColphonedB)

Analisis Pemayaan Gene (GSEA)

Analisis sampel-sampel

Clustering Cell:

Analisis Kontribusi Bedan: Kluster DGS

Analisis Inter-Grosir

Analisis Kontrit Diferensial: Group DGS

Analisis majeng:

Analisis Pseudotime:

Analyisan Siklus Cell:

Jelajahi kemajuan sing digampangake dening Layanan Sequencing RNA Tunggal Bmkgene kanthi 10x kromium ing publikasi sing ditampilake:

Wang, L. et al. (2021) 'Analisis transkriptomik tunggal-sel mbukak lanskap paru-paru ing steroid-tahan exacerbation',Proses Akademi Ilmu Nasional Nasional Amerika Serikat, 118 (2), p. e2005590118. DOI: 10.1073 / pnas.2005590118

Zheng, H. et al. (2022) 'Jaringan Regulasi global kanggo ekspresi gen dyregulated lan tandha metabolik sing ora normal ing sel kekebalan ing penyakit microenvironment saka kuburan lan tiroiditis Hashimoto',Frontier ing Imunologi, 13, p. 879824. Doi: 10.3389 / fimmu.2022.879824 / BIBTEX.

Tian, H. et al. (2023) Transcriptome-sel Heterogeneitas lan Tanggapan Kekebalan Leukosites Sawise vaksinasi karo Edwardsiella Tarda sing ora aktif ing Flounder (ParaliaChthy Olivaceus) ',Akuakultur, 566, p. 739238. Doi: 10.1016 / J.Aquapulture.2023.739238.

YU, Y. et al. (2023) 'Therasi Photodinamik Mbenakake Asil saka Inhibitor Priksa Imun Via Ngatur Kekebalan Anti-Tumor ing Pasien Kanthi Kanker Gastric',Kanker Gastric, 26 (5), PP. 798-813. DOI: 10.1007 / S10120-023-01409-X / metrik.