Ngurangi Representasi Bisulfit Sequencing (RRBS)
Pengurutan Bisulfite Representasi Dikurangi (RRBS) wis muncul minangka alternatif biaya-efektif lan efisien kanggo Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) ing riset metilasi DNA. Nalika WGBS nyedhiyakake wawasan lengkap kanthi mriksa kabeh génom kanthi résolusi basis tunggal, biaya sing dhuwur bisa dadi faktor watesan. RRBS kanthi strategis nyuda tantangan iki kanthi selektif nganalisa bagean perwakilan saka genom. Metodologi iki gumantung marang pengayaan wilayah sing sugih pulo CpG kanthi pembelahan MspI sing diikuti karo pilihan ukuran fragmen 200-500/600 bps. Akibate, mung wilayah sing cedhak karo pulo CpG sing diurutake, dene sing duwe pulo CpG sing adoh ora kalebu saka analisis. Proses iki, digabungake karo urutan bisulfit, ngidini deteksi metilasi DNA kanthi resolusi dhuwur, lan pendekatan urutan, PE150, fokus khusus ing ujung sisipan tinimbang tengah, nambah efisiensi profil metilasi. RRBS minangka alat sing larang regane sing ngidini riset metilasi DNA kanthi biaya-efektif lan nambah kawruh babagan mekanisme epigenetik.
Fitur Layanan
● Mbutuhake génom referensi.
● DNA Lambda digunakake kanggo ngawasi efisiensi konversi bisulfit.
● Efisiensi pencernaan MspI uga dipantau.
● Pencernaan enzim kaping pindho kanggo conto tanduran.
● Sequencing ing Illumina NovaSeq.
Kaluwihan Service
●Alternatif biaya-efektif lan efisien kanggo WGBS: mbisakake analisis ditindakake kanthi biaya sing luwih murah lan kanthi syarat sampel sing luwih murah.
●Platform lengkap:nyedhiyakake layanan sing apik banget saka pangolahan sampel, konstruksi perpustakaan, lan urutan kanggo analisis bioinformatika.
●Keahlian ekstensif: karo proyek urutan RRBS kasil rampung ing macem-macem spesies, BMKGENE ndadekke liwat dasawarsa pengalaman, tim analisis Highly trampil, isi lengkap, lan support post-sales banget.
Spesifikasi Layanan
| Pustaka | Strategi Sequencing | Output data sing disaranake | Kontrol kualitas |
| MspI digested lan bisulfite dianggep perpustakaan | Illumina PE 150 Kab | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Konversi bisulfit> 99% Efisiensi pemotongan MspI> 95% |
Syarat Sampel
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) |
| |
| DNA genomik | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradasi utawa kontaminasi winates |
Alur Kerja Layanan
pangiriman sampel
Konstruksi perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Layanan sawise-sale
Kalebu analisis ing ngisor iki:
● Kontrol kualitas urutan mentah;
● Pemetaan kanggo referensi génom;
● Deteksi basa methylated 5mC lan identifikasi motif;
● Analisis distribusi metilasi lan perbandingan sampel;
● Analisis Wilayah Diferensial Metilasi (DMR);
● Anotasi fungsional gen sing digandhengake karo DMR.
Kontrol kualitas: efisiensi pencernaan (ing pemetaan genom)
Kontrol kualitas: konversi bisulfit (ing ekstraksi info metilasi)
Peta metilasi: distribusi genom metilasi 5mC
Perbandingan sampel: Analisis Komponen Utama
Analisis Differentially Methylated Regions (DMRs): peta panas
Jelajahi kemajuan riset sing difasilitasi dening layanan urutan bisulfit genom kabeh BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.
Li, Z. et al. (2022) 'Reprogramming High-fidelity menyang sel kaya Leydig kanthi aktivasi CRISPR lan faktor paracrine',PNAS Nexus, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. et al. (2023) 'Analisis metilasi DNA genom saka komposisi awak ing kembar monozigot Cina',Jurnal Investigasi Klinis Eropa, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'Metilasi DNA lan rasio pinggul-pinggul: studi asosiasi epigenome ing kembar monozigot Cina',Jurnal Penyelidikan Endokrinologis, 45(12), kaca 2365–2376. doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
