● Pangolahan sampel RNA melu RRNA RRNA sing diikuti karo persiapan perpustakaan RNA arah.
● Analisis bioinformatic adhedhasar alignment menyang genome referensi
● Analisis kalebu ekspresi gen lan degs nanging uga struktur transkrip lan analisa SRNA
●Kontrol kualitas sing angel: Kita ngetrapake poin kontrol inti ing kabeh tahap, saka sampel lan persiapan perpustakaan kanggo urutan lan bioinformatics. Ngawasi meticulous iki njamin pangiriman asil sing berkualitas kanthi konsisten.
●Data urutan khusus strande: Amarga persiapan perpustakaan RNA dadi arah transkrip anti-eneng.
●Analisis lengkap sing disesuaikan karo transcripmom prokaryotik: Pipelin bioinformatic kalebu ora mung nganalisis ekspresi gen nanging uga analisis struktur transkrip, kalebu identifikasi operen, kanggo utr lan promotor. Uga kalebu analisis saka Srnas, yaiku annotasi lan ramalan struktur lan target.
●Dhukungan pasca sales: Komitmen kita ngluwihi rampung proyek kanthi periode layanan sawise 3 wulan. Sajrone wektu kasebut, kita nawakake pitulung proyek tindakake, ngatasi masalah, lan Q & A sesi kanggo ngatasi pitakon sing ana gandhengane.
Perpustakaan | Strategi Sequencing | Data Disaranake | Kontrol Kualitas |
Perpustakaan arah RRNA | Illumina PE150 | 1-2 GB | Q30≥85% |
Conc. (Ng / μL) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
≥ 50 | ≥ 1 | OD260 / 280 = 1.8-2.0 OD260 / 230 = 1.0-2.5 Winates utawa ora ana kontaminasi DNA sing ditampilake ing gel. | Rin≥6.5 |
Wadhah: 2 tabung ml cuansifuge (foil timah ora disaranake)
TAMPILAN LABELING: GROUP + TINDAK EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Ice garing: Sampel kudu dikempalken ing kantong lan dikubur ing es garing.
2 .. Tabung rnastable: Sampel RNA bisa garing ing tabung stabilisasi RNA (contone RNATTABLIZAL TUBE (eg rnastabel®) lan dikirim ing suhu kamar.
Kalebu analisis ing ngisor iki:
● Kontrol kualitas data mentah
● Alignment menyang Genome Rujukan
● Penilai kualitas perpustakaan: RNA Fragmentation Roma, lebokake ukuran lan urutan
● Annotasi fungsional gen coding sing diramalake
● Analisis ekspresi: korél lan analisis komponen utama (PCA)
● diedumumasi gen gen (degs)
● Annotasi fungsi lan pengeluaran degs
● Analisa Srna: ramalan, anotasi, target, lan ramalan struktur sekunder
● Analysis struktur transkrip: operek, posisi lan mungkasi posisi, Wilayah sing ora ana gandhengane (uts), promotor, lan analisis snp / indel
Saturation Saturation
Annotasi fungsi gen coding
Korelasi antarane conto
Analisis diferensial (degs) sing diungkapake
Analisa pengeluar fungsional
Annotasi SRNA
Jelajahi kemajuan sing digampangake dening Layanan Sequencing lengkap Nanopore Bmkgene ing publikasi sing ditampilake iki.
Guan, CP et al. (2018) 'Transcriptome Global owah-owahan epidermidis Biofilmoccus nanggapi Total Alkaloid of Sophorea alopeqekiroides',Jurnal Mikrobiologi Polandia, 67 (2), p. 223. Doi: 10.21307 / PJM-2018-024.