-
Genomik Komparatif
Genomik komparatif nyakup pemeriksaan lan mbandhingake kabeh urutan lan struktur genom ing antarane spesies sing beda-beda. Bidang iki ngupaya kanggo mbukak évolusi spesies, decode fungsi gen, lan njlentrehake mekanisme pangaturan genetik kanthi ngenali struktur lan unsur urutan sing dikonservasi utawa divergen ing macem-macem organisme. Panaliten genomik komparatif sing komprehensif nyakup analisis kayata kulawarga gen, pangembangan evolusi, kedadeyan duplikasi genom kabeh, lan pengaruh tekanan selektif.
-
Genetika Evolusi
Platform analisis genetik populasi lan evolusi diadegake adhedhasar pengalaman gedhe sing diklumpukake ing tim R&D BMK sajrone pirang-pirang taun. Iki minangka alat sing ramah pangguna utamane kanggo peneliti sing ora jurusan bioinformatika. Platform iki mbisakake analisis dhasar sing gegandhengan karo genetika evolusioner kalebu konstruksi wit filogenetik, analisis disekuilibrium link, penilaian keragaman genetik, analisis sapuan selektif, analisis kekerabatan, PCA, analisis struktur populasi, lsp.
-
Majelis Genom adhedhasar Hi-C
Hi-C minangka cara sing dirancang kanggo njupuk konfigurasi kromosom kanthi nggabungake interaksi basis proximity probing lan urutan throughput dhuwur. Intensitas interaksi kasebut dipercaya ana hubungane negatif karo jarak fisik ing kromosom. Mula, data Hi-C digunakake kanggo nuntun pengelompokan, urutan, lan orientasi urutan sing dirakit ing draf genom lan nyepetake kasebut ing sawetara kromosom tartamtu. Teknologi iki nguatake perakitan genom tingkat kromosom tanpa ana peta genetik adhedhasar populasi. Saben genom mbutuhake Hi-C.
-
Tanduran / Kewan De Novo Genome Sequencing
De Novosequencing nuduhake pambangunan genom kabèh spesies nggunakake teknologi urutan tanpa ana génom referensi. Pambuka lan adopsi nyebar saka urutan generasi katelu, sing nampilake maca sing luwih dawa, wis ningkatake perakitan genom kanthi nambah tumpang tindih antarane maca. Peningkatan iki utamané penting nalika nangani génom sing nantang, kayata sing nuduhaké heterozigositas dhuwur, rasio wilayah sing bola-bali, poliploid, lan wilayah kanthi unsur sing bola-bali, isi GC sing ora normal, utawa kerumitan dhuwur sing biasane kurang dirakit kanthi nggunakake urutan maca cekak. piyambakan.
Solusi siji-mandeg kita nyedhiyakake layanan urutan terintegrasi lan analisis bioinformatik sing nyedhiyakake genom sing dirakit de novo berkualitas tinggi. Survei genom dhisikan karo Illumina nyedhiyakake prakiraan ukuran lan kerumitan genom, lan informasi iki digunakake kanggo nuntun langkah sabanjure urutan maca sing dawa karo PacBio HiFi, banjursaikirakitan contigs. Panggunaan perakitan HiC sabanjure mbisakake anchoring contigs menyang génom, entuk perakitan tingkat kromosom. Pungkasan, génom kasebut diwènèhi anotasi kanthi prediksi gen lan kanthi urutan gen sing ditulis, nggunakake transkrip kanthi maca cekak lan dawa.
-
Manungsa Whole Exome Sequencing
Human Whole exome sequencing (hWES) diakoni sacara luas minangka pendekatan urutan sing efektif lan kuat kanggo nemtokake mutasi sing nyebabake penyakit. Senadyan mung kira-kira 1,7% saka kabeh génom, ekson nduweni peran wigati kanthi langsung nggambarake profil fungsi protein total. Utamane, ing génom manungsa, luwih saka 85% mutasi sing ana hubungane karo penyakit katon ing wilayah pengkodean protein. BMKGENE nawakake layanan urutan exome manungsa sing komprehensif lan fleksibel kanthi rong strategi penangkapan exon sing kasedhiya kanggo nggayuh macem-macem tujuan riset.
-
Urutan Fragmen Diperkuat Lokus Khusus (SLAF-Seq)
Genotyping high-throughput, utamane ing populasi skala gedhe, minangka langkah dhasar ing studi asosiasi genetik lan nyedhiyakake basis genetis kanggo panemuan gen fungsional, analisis evolusi, lan liya-liyane.Urutan Genome Representasi Dikurangi (RRGS)asring dipunginaaken ing pasinaon iki kanggo nyilikake biaya urutan saben sampel nalika njaga efficiency cukup ing panemuan panandha genetik. RRGS entuk iki kanthi nyerna DNA nganggo enzim pembatasan lan fokus ing sawetara ukuran fragmen tartamtu, mula mung ngurutake bagian sekedhik saka genom. Antarane macem-macem metodologi RRGS, Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF) minangka pendekatan sing bisa disesuaikan lan berkualitas tinggi. Cara iki, dikembangake kanthi mandiri dening BMKGene, ngoptimalake enzim watesan sing disetel kanggo saben proyek. Iki njamin ngasilake tag SLAF sing akeh banget (wilayah 400-500 bps saka genom sing diurutake) sing disebarake kanthi seragam ing genom nalika kanthi efektif ngindhari wilayah sing bola-bali, saengga njamin panemuan panandha genetik sing paling apik.
-
Pustaka pra-digawe Illumina
Teknologi urutan Illumina, adhedhasar Sequencing by Synthesis (SBS), minangka inovasi NGS sing dianut sacara global, tanggung jawab kanggo ngasilake luwih saka 90% data urutan donya. Prinsip SBS nyakup pencitraan terminator sing bisa dibatalake kanthi label fluoresensi nalika saben dNTP ditambahake, lan banjur dibelah kanggo ngidini panggabungan basis sabanjure. Kanthi kabeh papat terminator-bound dNTP bisa dibalèkaké ana ing saben siklus urutan, kompetisi alam minimalake bias penggabungan. Teknologi serbaguna iki ndhukung perpustakaan siji-maca lan pustaka sing dipasangake, nyedhiyakake macem-macem aplikasi genomik. Kapabilitas dhuwur-throughput lan presisi Illumina sequencing minangka landasan ing riset genomik, nguatake para ilmuwan kanggo mbongkar seluk-beluk genom kanthi detail lan efisiensi sing ora ditandingi.
Layanan urutan perpustakaan sing wis digawe ngidini para pelanggan nyiyapake perpustakaan urutan saka macem-macem sumber (mRNA, genom wutuh, amplikon, perpustakaan 10x, lan liya-liyane). Sabanjure, perpustakaan kasebut bisa dikirim menyang pusat urutan kanggo kontrol kualitas lan urutan ing platform Illumina.
