Transcriptome Lengkap Nanopore

Urutan transcriptome Transcriptome minangka cara sing kuat kanggo urutan Cdnas kanthi lengkap, kanthi tepat ngenali lan ngitung terkrip isoform. BmkCloud Nanopore Pipeline lengkap kanggo nganalisa data Rna-SEQ sing digawe ing genome referensi sing berwarna kanthi kualitas tinggi, nyedhiyakake kualitatif lan jumlah kualitatif ing tingkat gen lan transkrip. Sawise kontrol kualitas, urutan non-chimeric (flnc) sing lengkap dipikolehi lan urutan konsensus dipikliti menyang genome referensi kanggo mbusak transkrip sing luwih akeh. Saka pesawat transkrip, ekspresi kasebut diitung lan diferensially nyatakake gen lan transkrip sing diidentifikasi lan fungsi kanthi fungsi. Pipeline uga kalebu analisis polyadenylation (APA) alternatif, Analisis Penyambungan Alternatif, Analisis Penyambungan Sederhana, Ramalan Sequencent, CDS), Analisis Family Gene, Analoning Factor Gen, Ramalan Gen Novel lan anotasi transkrip fungsional.