mRNA-seq (NGS) - De novo

Urutan mRNA ngidini nggawe profil kabeh transkrip mRNA ing sel ing kahanan tartamtu lan minangka teknologi sing akeh digunakake ing macem-macem wilayah riset. Pipa BMKCloud De novo mRNA-seq dirancang kanggo nganalisa perpustakaan urutan sing diperkaya poly-A nalika ora ana genom referensi. Pipa kasebut diwiwiti kanthi kontrol kualitas, disusulsaikiperakitan transkrip lan pilihan set unigene. Analisis struktur unigene prédhiksi urutan pengkodean (CDS) lan pengulangan urutan prasaja (SSR). Salajengipun, analisis ekspresi diferensial nemokake gen sing diungkapake kanthi beda (DEG) ing antarane kondisi sing dites, diikuti karo anotasi fungsional lan pengayaan DEG kanggo ngekstrak wawasan biologi.