Analisis MRNA Eukaryotik (Rujukan adhedhasar lan pilih de Nove kasedhiya)
Pipa iki nggunakake data rna-seq minangka input saka macem-macem analisa downstream kalebu nanging ora diwatesi kanggo: penilaian kualitas data,de NovoAnnotasi situs transkrip, analisis panyambungan variabel, analisis ekspresi diferensial, analisasi anotasi fungsi lan pengetan.
Analisis RNA sing ora coding dawa
RN-coding dawa (LNCRNRNA) minangka transkrip coding kanthi dawa kanthi luwih dawa tinimbang 200 NT lan dikenal kanggo muter peran ing organisasi kromatin. Teknologi urutan lan bioinformatik dhuwur-throughput dhuwur wis mimpargi urutan LNCRNA lan informasi posisi kanggo ngenali Lncrnas kanthi fungsi pangaturan kanthi akulator. Pipeline iki nyedhiyakake analisis LNCRNA saliyane analisa sing kasebut ing eukaryotik analisis MRNA.
16s / 18s / urutan Amplicon
Pipeloris analisis lain-amplicon kanthi mikrobal lingkungan dikembangake adhedhasar pengalaman ing taun pengalaman ing analisis proyek mikrobial. Pipeline ngemot analisis dhasar standar, sing kalebu konten analisis utama babagan riset mikroba lan analisis pribadi. Laporan analisis kasebut sugih lan lengkap, kanthi pilihan kanggo nindakake macem-macem analisis pribadi. Kajaba iku, conto lan klompok bisa diowahi ing fly kanggo kustomisasi lan kontrol tambahan.
Sembarang Analisis Metagun
Pipa metalomik bedhil metagun nggunakake data ngs saka bahan genomik sing dicampur saka conto lingkungan. Kalebet analisa nyedhiyakake informasi rinci babagan macem-macem spesies lan akeh, struktur pedunung, hubungan phylogenetic, fungsional fungsional kanthi faktor lingkungan.
Analisis varian NGS-WGS
Analisis varian NGS-WGS minangka pipelinasi deteksi varian terintegrasi sing nindakake kontrol kualitas data, urutan urutan, annotasi, lan analisis mutasi. Pipeline ngetutake praktik paling apik GATK kanggo deteksi SNP lan Indel lan nggunakake Manta kanggo nelpon varian struktural.
Sinau babagan asosiasi genome (GWAS)
Pipa Gwas minangka analisis hilir sing mbutuhake file vcf sing wis digawe sadurunge lan data fenotype sing cocog kanggo nyalon individu minangka input. Nggunakake metodologi statistik khusus, GWAS tujuan kanggo mbukak variasi nukleotida sing genome sing digandhengake karo prabédan fenotipasi. Iki nduweni peran penting kanggo njelajah gen fungsional sing ana gandhengane karo penyakit manungsa lan sipat sing rumit ing tanduran lan kewan.
Analisis segregasi akeh (BSA)
Analisis BSA nglibatake individu blumbang kanthi sipat fenotip sing ekstrem saka populasi sing segregasi. Kanthi mbandhingake macem-macem kaloro conto sing ditanduri, pendekatan iki kanthi cepet ngerteni tandha molekuler sing ana gandhengane karo target gen. Digunakake kanthi wiyar ing pemetaan tanduran lan kewan, iku alat sing migunani kanggo pembiakan sing dibantu.
Analisa genetik evolusi
Working Analisis Evolusioner Workflow nggunakake pengalaman ekstensif Bmkgene ing proyek evolusi genetik lan kalebu konstruksi Sapuan Distrik, analisis komponèt genetik, analisis komponen utama, lan karakterisasi struktur penduduk, analisis komponen utama, lan karakterisasi struktur penduduk.
