Eukariotik mRNA Sequencing-NGS
Fitur
● Jupuk mRNA poli sadurunge persiapan perpustakaan
● Persiapan perpustakaan mRNA arah opsional kanggo ngaktifake data urutan spesifik untaian
● Analisis bioinformatika ekspresi gen lan struktur transkrip
Kaluwihan
●Keahlian ekstensif: Tim kita wis ngolah luwih saka 600.000 conto ing BMKgene, kalebu macem-macem jinis sampel kayata kultur sel, jaringan, lan cairan awak. Kita nggawa akeh pengalaman kanggo saben proyek lan wis sukses ngrampungake luwih saka 100.000 proyek mRNA-Seq ing macem-macem domain riset.
●Kontrol Kualitas sing ketat: Kita ngetrapake titik kontrol inti ing kabeh tahapan, saka persiapan sampel lan perpustakaan nganti urutan lan bioinformatika. Pemantauan sing tliti iki njamin asil sing terus-terusan kualitas, njamin proyek sampeyan bisa dipercaya.
●Anotasi Komprehensif: Kita nggunakake macem-macem database kanggo fungsi annotate ing Differentially Expressed Genes (DEGs) lan nindakake analisis pengayaan cocog. Pendekatan komprehensif iki menehi wawasan babagan proses seluler lan molekuler sing ndasari respon transkriptom, supaya sampeyan ngerti kanthi lengkap babagan asil proyek sampeyan.
●Dhukungan Post-Sales: Komitmen kita ngluwihi proyek rampung kanthi wektu layanan sawise-sale 3 sasi. Sajrone wektu iki, kita nawakake tindak lanjut proyek, pitulungan ngatasi masalah, lan sesi Q&A kanggo ngatasi pitakon apa wae sing ana gandhengane karo asil.
Syarat Sampel lan Pangiriman
| Pustaka | Strategi urutan | Data dianjurake | Kontrol kualitas |
| Poly A enriched | Illumina PE 150 Kab DNSSEQ-T7 | 6 - 10 Gb | Q30≥85% |
Syarat Sampel:
Nukleotida:
| Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas | |
| Pustaka Standar | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel. | Kanggo tetanduran: RIN≥4.0; Kanggo kewan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; winates utawa ora elevasi baseline |
| Pustaka Arah | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein utawa DNA diwatesi utawa ora ditampilake ing gel. | Kanggo tetanduran: RIN≥4.0; Kanggo kewan: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; winates utawa ora elevasi baseline |
● Tanduran:
ROOT, Batang utawa Petal: 450 mg
Godhong utawa Wiji: 300 mg
Woh: 1,2 g
●kewan:
Jantung utawa Usus: 300 mg
Viscera utawa Otak: 240 mg
Otot: 450 mg
Balung, Rambut utawa Kulit: 1g
● Artropoda:
serangga: 6 g
Crustacea: 300 mg
● Getih wutuh: 1 tub
● Sel: 106 sel
Pangiriman Sampel sing Disaranake
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (Timah foil ora dianjurake)
Labeling sampel: Group+replikat contone A1, A2, A3; B1, B2, B3....
Kintunan:
1. Es garing: Sampel kudu dikemas ing tas lan dikubur ing es garing.
2. Tabung tabel RNA: Sampel RNA bisa dikeringake ing tabung stabilisasi RNA (umpamane RNAstable®) lan dikirim ing suhu kamar.
Alur Kerja Layanan
Desain eksperimen
pangiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Layanan sawise-sale
Bioinformatika
Eukariotik alur kerja analisis urutan mRNA
Bioinformatika
ØKontrol kualitas data mentah
Øalignment genom referensi
ØAnalisis struktur transkrip
ØEkspresi kuantifikasi
ØAnalisis ekspresi diferensial
ØAnotasi fungsi lan pengayaan
Referensi Genome Alignment
Saturasi Data
Korelasi sampel lan penilaian replika biologis
Differentially Expressed Gens (DEG)
Anotasi Fungsional DEGs
Pengayaan Fungsional saka DEGs
Jelajahi kemajuan sing difasilitasi dening layanan urutan mRNA NGS eukariotik BMKGene liwat koleksi publikasi sing dipilih.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan lan triclocarban ngurangi kapasitas olfaktori iwak mas kanthi mbatesi pangenalan bau, ngganggu transduksi sinyal olfaktori, lan ngganggu pangolahan informasi olfaktori', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus mbajak manungsa p11 kanggo ngarahake fagosom sing ngandhut jamur menyang jalur non-degradatif', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Faktor Transkripsi TCP sing Terlibat ing Pengembangan Pucuk Bambu Ma (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389 / FPLS.2022.884443 / BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'The Chrysanthemum lavandulifolium génom lan mekanisme molekul ndasari jinis capitulum manéka warna', Riset Hortikultura, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'A nanoreaktor kaskade kanggo ningkatake terapi sonodinamik ing kanker kolorektal liwat sinergis ROS nambah lan pamblokiran autophagy', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
