Genomik Compatiative
Keuntungan Layanan
●Peluah lan rekaman publikasi: Kanthi akumulasi, Bmkgene wis rampung luwih saka 90 proyek genomik komparatif, kanthi faktor pangaruh kumulatif tekan 900.
●Analisis bioinformatika lengkap: Paket analisa ngemot wolung analisa sing paling umum dibutuhake, nyedhiyakake tokoh siap sing wis dirancang kanthi apik lan ngidini interpretasi asil gampang
●Tim bioinformatics sing trampil lan siklus analisis sing trampil: Kanthi pengalaman sing apik kanggo analisis genomik komparatif, tim Bmkgene ngetrapake macem-macem analisis pribadi kanthi cepet ing wektu
●Dhukungan pasca sales:Komitmen kita ngluwihi rampung proyek kanthi wektu layanan sawise 3 wulan. Sajrone wektu kasebut, kita nawakake pitulung proyek tindakake, ngatasi masalah, lan Q & A sesi kanggo ngatasi pitakon sing ana gandhengane.
Spesifikasi Layanan
| Ngira-ngira-pirang-pirang wektu | Jumlah spesies | Nganalisa |
| 30 dina kerja | 6 - 12 | Kluster kulawarga gen Pengembangan Kulawarga Gene Konstruksi Wit Phylogenetic Pengirangan Wektu Ngira-ngira (Kalibrasi Fossiil) Sisipan LTR (kanggo tanduran) Genome genome duplikat (kanggo tanduran) Tekanan Selektif Analisa synteny |
Bioinformatics nganalisa
● kulawarga gen
● phylogenetics
● DeverGence Wayahe
● Tekanan sing dipilih
● Analisis Synteny
Syarat syarat lan pangiriman
Syarat conto:
Jaringan utawa dna kanggo urutan lan patemon genome
Kanggo jaringan
| Spesies | Tisu | Survey | Pacbio CCS |
| Kewan | Jaringan visceral | 0.5 ~ 1 g | ≥ 3.5 g |
| Jaringan otot | |||
| ≥ 5.0 g | |||
| ≥ 5.0 ml | |||
| Getih Mamalia | |||
| ≥ 0,5 ml | |||
| Darah unggas / Iwak | |||
| Tanduran | Godhong seger | 1 ~ 2 g | ≥ 5.0 g |
| Petal / Batang | 1 ~ 2 g | ≥ 10.0 g | |
| ROOT / Wiji | 1 ~ 2 g | ≥ 20,0 g | |
| Sel | Sel sing dikuasai | - | ≥ 1 x 108 |
Data
File urutan genom (.fasta) lan file annotasi (.gff3) spesies sing gegandhengan karo rapet
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pangiriman Contoh
Konstruksi Perpustakaan
Urutan
Analisis Data
Layanan Sawise-adol
*Demo sing ditampilake ing kene kabeh saka genom sing diterbitake karo biomarker Technologies
1.Lemtokake Pasang wektu: tokoh kasebut nuduhake distribusi bimode unik ing kaping licr-RTS Sisipan ing Genome Rye, dibandhingake karo spesies liyane. Puncak paling anyar ditampilake udakara 0,5 yuta taun kepungkur.
Li Guang et al.,Genetika Alam, 2021
2.phylogeny lan analisis kulawarga Gene ing Chayote (Sechium Ede): Kanthi nganalisa chayote lan 13 spesies liyane sing gegandhengan karo kulawarga Gene, Chayote ditemokake paling rapet karo Snake Gourd (Trichosanthes Anguina). Chayote asale saka snake gaun ing sekitar 27-45 mya lan genome genome (WGD) diamati ing Chayote ing 25 ± 4 mya, yaiku acara WGD katelu ing cucu.
Fu et al.,Riset Hortikultur, 2021
Analisis 3.syntyneny: Sawetara gen sing ana gandhengane karo phytohormones ing pangembangan buah ditemokake ing chayote, ula gourd lan squash. Korelasi antarane chayote lan squash rada dhuwur tinimbang ing antarane chayote lan snake gourd.
Fu et al.,Riset Hortikultur, 2021
4.Gawe analisis kulawarga: Pengayaan kegg ing ekspansi kulawarga gen lan kontraksi ing G.Thurberi lan G.DavidsonIi genom sing ditampilake kanthi biosintesis steroid lan biosintesis brassenteroid sing gegandhengan karo gen sing ana gandhengane.
Yang Z et al.,Biologi Bmc, 2021
5. Nggunakake analisis duplikat genome: Analisis distribusi 4dtv lan KS sing ditampilake kabeh prastawa duplikat genome. Puncak intraspecies sing dituduhake acara duplikat. Puncak Interspesion Interspesion sing ditampilake. Analisis kasebut nuduhake yen mbandhingake karo telung spesies liyane sing gegandhengan, O. Europaea ngliwati duplikat gen skala gedhe luwih anyar.
Rao g et al.,Riset Hortikultur, 2021
Kasus Bmk
Wungu tanpa prickle: Wawasan genomik sing ana gandhengane karo kelembapan adaptasi
Diterbitake: Review Ilmu Nasional, 2021
Strategi Sequencing:
'Basye'sThornless'(R.Wichurainan) Genome:
Kira-kira. 93 x Pacbio + kira-kira. 90 x Nanopore + 267 x Illumina
Asil utama
1.Phigh Quality R.Wicichuraana Genome dibangun kanthi nggunakake teknik urutan sing dawa, sing ngasilake patemon 525.5 kanthi ukuran syometri lan 525.5 kanthi genom saka jembatan; Skor kira-kira busco yaiku 93,9%. Bandhingake karo "blush lawas" (haploob), kualitas lan ngrampungake genom iki dikonfirmasi kanthi akurasi tunggal dhasar-basis lan indeks mitrem (Lai = 20.03). Genome R.wicicuraana ngemot 32,674 gen coding protein.
Analisis sendhi 2.multi-ibu, kalebu genomik komparatif, transkriptomics, qtl analisis populasi genetik, ngungkapake spekulasi penting ing antarane R. Wichuraana lan Rosa Chinensis. Uga, ekspresi variasi gen sing gegandhengan karo QTL cenderung digandhengake karo stem prickle patter.
Perusahaan Anayis Genomik ing antarane Basyless lan Rosa Chinensis kalebu analisis synteny, kluster kulawarga, nganakake analisis variasi, sing ana hubungane karo ciri penting ing mawar. Pengembangan unik ing kulawarga Nac lan FAR1 / FRS GEN GENLONG ING NGANGGO INGGRIS DENGAN KABUPATEN TOKIL.
Analisis Genomik Comparative antarane Genom BT lan Haploob.
Zhong, M., et al. "Rose tanpa prickle: Wawasan Genomik sing ana gandhengane karo kelembapan adaptasi"Review Ilmu Nasional, 2021;, NWAB092.
