Urutan amplicon (16s / 18s / HIS)

Amplicon (16s / 18S / ITSIONSI) karo Illumina yaiku metode nganalisa macem-macem mikrobial profil kanthi ngidentifikasi profil lan uga nyoba kanggo nemtokake conto masarakat lan ing antarane conto. Pipa pipa BMKCloud Amplicon (NGS) ngidini analisis 16, 18, lan macem-macem gen. Diwiwiti karo trimming maca, dipasangkan maca Majelis lan evaluasi kualitas, diikuti karo clustering maca sing padha kanggo ngasilake unit taksonomi operasi (OTUS) sing digunakake ing enem bagean sing beda. Anotasi taksonomi nyedhiyakake informasi babagan terbuka lan komposisi saben conto, dene nganalisa macem-macem Alfa lan Beta fokus ing macem-macem ukuran mikrobial lan ing antarane conto. Analisis diferensial antara klompok nemokake OTU sing beda-beda nggunakake tes para parametrik lan non-parametrik, dene analisis korélasi ana prabédan kasebut kanggo faktor lingkungan. Pungkasan, akeh gen sing diadegake adhedhasar akeh gen gen, nyedhiyakake wawasan babagan fungsi lan ekologi ing saben conto ..