Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud Mlebu

Produk

16s / 18S / Sequencing Amplicon-Pacbio

16s / 18S / Sequencing Sequencing-Pacbio Fitur Gambar

Gen sing ana 16 lan 18, kanthi spacer internal transcribed internal, dadi penanda sidik molekal sing cocog amarga kombinasi macem-macem lan hiper sing beda-beda kanggo negesake organisme prokaryotik lan eukaryotik. Amplification lan urutan wilayah kasebut nawakake pendekatan bebas sing isolasi kanggo nyelidiki komposisi mikroba lan bhinéka ing macem-macem ekosistem. Nalika urutan ilologis biasane target wilayah hiperis sing cendhak kaya v3-v4 saka 16s lan1, wis nuduhake manawa anotenomis taksonomi sing bisa digayuh kanthi urutan lengkap 16s, 18-an, lan. Cara pendekatan lengkap iki nyebabake persentase urat sing luwih dhuwur saka urutan sing wis diklasifikasikake kanthi dhuwur, entuk tingkat resolusi sing nyebar identifikasi spesies. Platform urutan-molekul Pasio-Molecule (SMRRT) kanthi cara sing dawa banget (Hifi) sing akurat banget (Hifi) sing nutupi amporon sing dawa, saestu tliti saka urutan Illumina. Kapabilitas iki ngidini para peneliti kanggo entuk keuntungan sing ora cocog - tampilan panorama lanskap genetik. Jangkoan lengkap mundhak kanthi résolusi ing annotasi spesies, utamane ing komunitas bakteri, utamane ing komunitas bakteri utawa jamur, ngaktifake pangerten populasi mikroba.

Hubungi kita

Rincian Layanan

Bioinformatics

Demo asil

Publications sing ditampilake

Fitur Layanan

● Platform Sequencing: Pacbio Revio

● Mode Sequencing: CCS (maca HiFi)

● Amplifikasi wilayah target sing diikuti karo tandem link amplicons sadurunge hifi smrt bell perpustakaan

Keuntungan Layanan

●Résolusi Taksonomi sing luwih dhuwur: tHan Short-Amphlic Sequencing,Ngaktifake tarif klasifikasi OTU sing luwih dhuwur ing tingkat spesies.

●Nelpon dhasar sing akurat banget: Mode Mode Pacbio CCS (maca Hifi).

●Isolation-free: Identifikasi kanthi cepet komposisi mikroba ing conto lingkungan.

●Ditrapake kanthi akeh: Studi komunitas mikroba.

●Analisis bioinformatic sing komprehensif: Paket QIIME2 paling anyar (wawasan kuantitatif menyang Écologi mikrobis) kanthi macem-macem nganalisa babagan database, annotasi, OTNATION, OTHNASI / ASV.

●Keahlian ekstensif: Kanthi ewu proyek urutan amplicon sing ditindakake saben taun, Bmkgene ngalami pengalaman, tim analisis sing trampil, konten sing lengkap, lan dhukungan pasca sing lengkap.

Spesifikasi Layanan

Perpustakaan	Strategi Sequencing	Data Disaranake
Amplicon	Pacbio Revio	10/30/50 K Tags (CCS)

Syarat conto

Konsentrasi (ng / μL)	Jumlah (μg)	Volume (μL)
≥5	≥0.3	≥20

Pangiriman Contoh Disaranake

Bekalan conto ing nitrogen cair kanggo 3-4 jam lan simpen ing irung-nitrogen utawa -80 gelar dawa kanggo leladen jangka panjang. Contoh pengiriman nganggo es garing dibutuhake.

Aliran kerja layanan

Pangiriman Contoh

Konstruksi Perpustakaan

Urutan

Analisis Data

Layanan Sawise-adol

Sadurunge: 16s / 18S / Sequencing Amplicon-NGS

Sabanjure: Assay kanggo kromatin transposase kanthi urutan overload (atac-seq)

Kalebu analisis ing ngisor iki:

● Kontrol kualitas data mentah

● OTU Klustering / De-Noise (ASV)

● Anotasi OTU

● Analysis Alpha Diversitas: Multipaké indeks, kalebu Shannon, Simpson lan Ace.

● Analisis Beta Diversity

● Analisis antarmer-grup

● Analisis korélasi: antarane faktor lingkungan lan komposisi lan macem-macem

● 16 ramalan gen fungsional

Histogram saka distribusi taksonomi

Distribusi wit phylogenetic

Analisis Diversitas Alpha: ACE

indeks

Analisis Beta Diversity: Pcoa

Analisis Intergroup: Anova

Jelajahi kemajuan sing digampangake dening Layanan Sequencing Amplicon Bmkgene kanthi Pacbio liwat koleksi publikasi sing curated.

Gao, X. lan Wang, Analisis Komparatif Profesional lan Fungsi sajrone Adaption kanggo PHENOGY BEDHING (Fermentasi, 9 Bagean, 9 ( 1), p. 16. Doi: 10.3390 / fermentation9016/200 / s1.

Li, S. et al. (2023) 'Njupuk masalah gelap mikroba ing metagaik sing duwe berbasis berbasis lan analisis resolusi dhuwur', NPJ Biofilms lan mikrobiomma 20232: 1 (1), PP. DOI: 10.1038 / s41522-023-00439-8.

Mu, L. et al. (2022) 'Efek uyah asam lemak ing ciri fermentasi, keragaman bakteri lan stabilitas gandum lan bran gandum, 102 (4), 14), PP. 147), 1487. DOI: 10.1002 / jsfa.1482.

Yang, J. et al. (2023) 'interaksi antarane biokarker stres oksidatif lan mikrobiota usus ing efek antioksidan saka ekstrak saka sonchus brachyotus dc. Ing stres oksidatif usus ing oxazolone ing zebrafish diwasa ', antioksidan 2023, vol. 12, 192, 12 (1), p. 192. Doi: 10.3390 / Antiox12010192.