16s / 18S / Sequencing Amplicon-NGS
Fitur Layanan
● Platform Sequencing: Illumina Novaseq.
● Amplifikasi wilayah cendhak 16s, 18S lan, ing antarane target Amplifikasi liyane.
● Pilihan Fleksibel Amplicon.
● Pengalaman proyek sadurunge kanthi target amplifikasi.
Keuntungan Layanan
●Isolation-free:Identifikasi kanthi cepet komposisi mikroba ing conto lingkungan.
●Resolusi Dhuwur: Ing komponen sing akeh banget ing conto lingkungan.
●Ditrapake kanthi akeh: Studi komunitas mikroba.
●Analisis bioinformatic sing komprehensif: Paket QIIME2 paling anyar (wawasan kuantitatif menyang Écologi mikrobis) kanthi macem-macem nganalisa babagan database, annotasi, OTNATION, OTHNASI / ASV.
●Keahlian ekstensif: Kanthi 150 ewu proyek urutan amplicon sing ditindakake saben taun, Bmkgene ngalami pengalaman dekade, tim analisis sing trampil, konten sing lengkap, lan dhukungan pasca sing lengkap.
Spesifikasi Layanan
| Perpustakaan | Strategi Sequencing | Data Disaranake |
| Amplicon | Illumina PE250 | Tag 50/100 / 300K (Maca pasangan) |
Syarat layanan
| Konsentrasi (ng / μL) | Jumlah (ng) | Volume (μL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● lemah / sludge: 1-2g
● Konten usus-kewan: 0.5-2g
● isi usus serangga: 0.1-0.25g
● Lumahing tanduran (Sediment): 0.1-0.5g
● Fermentasi duduh kaleng duka duduh): 0.1-0.5g
● Faeces (kewan gedhe): 0.5-2G
● Faeces (mouse): 3-5grains
Cairan ● cairan lavage alveolar Pulmonari: Kertas Filter
● Swab vagina: 5-6 swab
● Skab / gen / saliva / lisan alus jaringan / sanjang / rectal swab / Swab rektum: 2-3 swab
● Mikroorganisme Survice: Filter kertas
● Banyu / Udara / Biofilm: Filter kertas
● Endofit: 1-2g
● Plaque Dental: 0.5-1G
Aliran kerja layanan
Pangiriman Contoh
Konstruksi Perpustakaan
Urutan
Analisis Data
Layanan Sawise-adol
Kalebu analisis ing ngisor iki:
- Kontrol kualitas data mentah
- OTU Clustering / De-Noise (ASV)
- Annotasi OTU
- Analisis Diversity Alpha: Multipes indeks, kalebu Shannon, Simpson lan Ace.
- Analisis baka beta
- Analisis Inter-Grosir
- Analisis korelasi: antarane faktor lingkungan lan komposisi lan macem-macem
- Prediksi Gene Fungsional 16s
Histogram saka distribusi taksonomi
Map Panas Cluse Taksonomi Abund
Analisis Diversitas Alpha: Kurva rareFaction
Analisis Beta Diversity: NMDS
Analisis Intergroup: Penemuan Biomark Lefse
Jelajahi kemajuan sing digampangake dening Layanan Sequencing Amplicon Bmkgene kanthi Illumina liwat koleksi publikasi sing curated.
Dong, C. et al. (2022) 'Majelis, mikrobiota inti, lan Fungsi RHIBIOTA lan mikrobiota RHIBIOTA ing EUCOMIIDER', DOI: 10.3389 / FMINB.202.855317 / Full.
Li, Y. et al. (2023) 'transisi konsoltortia bakterus sintetik kanggo perawatan vaginosis bakteri vaginal kebon kebon kebon ing tikus', mikrobiome, 11 (1), PP. 1-14. DOI: 10.1186 / S4068-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. Lan Liu, Mikrobiom H. (2022) ' 1-20. : 10.1186 / S40793-022-00399399-0 / tokoh / 8.
Yin, S. et al. (2022) 'Reedstock-gumantung saka gen fungsi fungsional sing ana gandhengane karo transformasi nitrogen sing dikontrol nitrogen ing komposis', teknologi bioresource, 361, p. 127678. Doi: 10.1016 / j.biortech.2022.127678.
