Transcriptome Spesialis 10x 10x
Skema Teknikal
Fitur
● Resolusi: 100 μm
● Detep diameterasi: 55 μm
● Nomer Spots: 4992
● Jupuk area: 6.5 x 6,5 mm
● Saben titik barcoded dimuat karo primer dumadi saka 4 bagean:
- Buntut Poly (DT) kanggo Sintesis Priming Mrna lan CDNA
- Pengenal molekuler (UMI) sing unik kanggo mbenerake bias amplifikasi
- Barcode spatial
- Urutan urutan sebagian maca 1 primer urutan
● H & E payerane bagean
Keuntungan
●Layanan Siji-Stop: Integrasi kabeh pengalaman lan langkah-langkah adhedhasar katrampilan, kalebu cryo-sectioning, pewarna, optimalisasi jaringan, nyipta spasial, persiapan perpustakaan, urutan lan bioinformatika.
● Tim teknis sing trampil: Kanthi pengalaman luwih saka 250 jinis jaringan lan 100+ spesies kalebu manungsa, mouse, mammal, iwak lan tanduran.
●Nganyari wektu nyata ing kabeh proyek: Kanthi kontrol kemajuan eksperimen.
●BioOnformatics standar lengkap:Paket kalebu 29 analisa lan 100+ angka sing berkualitas tinggi.
●Analisis lan analisis data sing disesuaikan: kasedhiya kanggo panjaluk riset sing beda.
●Analisis sendhi opsional kanthi urutan mrsna sel-sel
Spesifikasi
| Syarat conto | Perpustakaan | Strategi Sequencing | Data Disaranake | Kontrol Kualitas |
| Sampel Oct-Embed Cryo Oct (Diameter optimal: kira-kira. 6x6x6 mm³) 2 Blok saben conto | Perpustakaan CDNA 10X | Illumina PE150 | 50k PE maca saben titik (60GB) | Rin> 7 |
Kanggo katrangan lengkap babagan tuntunan persiapan lan alur kerja persiyapan, mangga bebas ngobrol karo aBmkgene ahli
Workflow Service
Ing Fase Persiyapan conto, nyoba ekstraksi rna awal sing ditindakake kanggo njamin RNA sing bermutu sing bermutu bisa dipikolehi. Ing Optimization Tisu Stage bagean kasebut di wernani lan visualisasi lan kahanan permeabilisasi kanggo release MRNA saka jaringan dioptimalake. Protokol sing dioptimalake banjur ditrapake nalika konstruksi perpustakaan, diikuti karo urutan lan analisis data.
Kerja kerja lengkap nglibatake update nyata lan konfirmasi klien kanggo njaga umpan balik tanggapan respon, njamin eksekusi proyek sing lancar.
Kalebu analisis ing ngisor iki:
Kontrol kualitas data:
o Data output lan distribusi skor kualitas
o Deteksi Gen saben titik
o Liputan jaringan
Analisis sampel--sampe:
o Gene kasugihan
o Spot clustering, kalebu suda analisis Dimensi
o Analisis ekspresi diferensial antarane kluster: identifikasi gen sing ditandha
o Anotasi fungsi lan pengeluaran gen sing ditandur
Analisis Inter-Grosir
o kombinasi bintik saka rong conto (kayata. lara lan kontrol) lan kluster maneh
o Identifikasi gen marker kanggo saben kluster
o Anotasi fungsi lan pengeluaran gen sing ditandur
o Ekspresi diferensial saka kluster sing padha antarane klompok
Analisis sampel-sampel
Titik Clustering
Identifikasi gen tandha lan distribusi spatial
Analisis Inter-Grosir
Gabungan data saka loro klompok lan kluster
Gen tandha saka kluster anyar
Jelajahi kemajuan sing digampangake dening layanan transcasomics Spatial Bmkgene kanthi 10x visium ing publikasi sing ditampilake:
Chen, D. et al. (2023) 'MThl1, homologi Drosophila sing potensial GPCR, sing ditindakake reaksi antitumor kanggo sel antitumor kanggo sel oncogenik ing lalat,Proses Akademi Ilmu Nasional Nasional Amerika Serikat, 120 (30), p. E2303462120. DOI: /10.1073/pnas.2303462120
Chen, Y. et al. (2023) 'baja mbisakake dalination resolusi dhuwur data transkriptomic',SUKTUT ING BioNformatics, 24 (2), pp. 1-10. DOI: 10.1093 / Bib / BBAD068.
Liu, C. et al. (2022) 'AVIOTOGENESSIS Organogenesis ing pangembangan kembang orkid',Panliten Asam Nukleat, 50 (17), PP. 9724-9737. DOI: 10.1093 / NAR / GKAC773.
Wang, J. et al. (2023) 'nggabungake transkriptomics spatial lan urutan rina tunggal nukleus ngumumake strategi terapeutik potensial kanggo leiomyoma sing uterine',Jurnal Ilmu Internasional Ilmu Ilmu Internasional, 19 (8), PP. 2515-2530. DOI: 10.7150 / IJbs.83510.
