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製品

全体のトランスクリプトームシーケンス - イルミナ

全体的なトランスクリプトームシーケンスは、多様なRNA分子をプロファイリングする包括的なアプローチを提供し、コーディング(mRNA)および非コーディングRNA(LNCRNA、CircrNA、およびmiRNA)を含みます。この手法は、特定の瞬間に特定の細胞のトランスクリプトーム全体をキャプチャし、細胞プロセスの全体的な理解を可能にします。 「Total RNAシーケンス」としても知られているこの目的では、競合する内因性RNA(CERNA)や関節RNA分析などの詳細な分析を可能にすることを目的としています。これは、特にCircrna-Mirna-MRNAベースのCerna相互作用を含む規制ネットワークの解明における機能的特性評価に向けた最初のステップを示します。


サービスの詳細

バイオインフォマティクス

デモの結果

注目の出版物

特徴

●完全なトランスクリプトームをシーケンスするデュアルライブラリ:RRNAの枯渇に続いてPE150ライブラリの準備とサイズの選択に続いてSE50ライブラリの準備

●個別のバイオインフォマティクスレポートにおけるmRNA、lncrNA、circrNA、およびmiRNAの完全なバイオインフォマティクス分析

●CERNAネットワーク分析を含む複合レポートにおけるすべてのRNA発現の共同分析。

サービスの利点

規制ネットワークの詳細な分析:CERNAネットワーク分析は、mRNA、lncRNA、CircrNA、およびmiRNAの共同シーケンスと、徹底的なバイオインフォマティックワークフローによって有効になります。

包括的な注釈:複数のデータベースを使用して、差次的に発現した遺伝子(deg)に機能的に注釈を付け、対応する濃縮分析を実行し、トランスクリプトーム応答の根底にある細胞および分子プロセスに関する洞察を提供します。

広範な専門知識:さまざまな研究領域で2100以上のトランスクリプトームプロジェクトを閉鎖するという実績により、私たちのチームはすべてのプロジェクトに豊富な経験をもたらします。

厳密な品質管理:サンプルやライブラリの準備からシーケンスやバイオインフォマティクスまで、すべての段階にわたってコア制御ポイントを実装します。この綿密な監視により、一貫して高品質の結果が得られます。

販売後のサポート:私たちのコミットメントは、3か月の販売後のサービス期間でプロジェクトの完了を超えています。この間、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、およびQ&Aセッションを提供して、結果に関連するクエリに対処します

サンプル要件と配信

図書館

シーケンス戦略

推奨されるデータ

品質管理

RRNAが枯渇しました

イルミナPE150

16ギガバイト

Q30≥85%

選択されたサイズ

イルミナSE50

10-20mの読み取り

サンプル要件:

ヌクレオチド:

conc。(ng/μl)

量(μg)

純度

誠実さ

≥80

≥1.6

OD260/280 = 1.7-2.5

OD260/230 = 0.5-2.5

ゲルに示されているタンパク質またはDNAの汚染が限られているか、DNAの汚染がない。

RIN以上の6.0

5.0≥28s/18S≥1.0;

ベースラインの標高が制限されていないか、なし

推奨サンプル配信

コンテナ:2 ml遠心分離機チューブ(スズ箔はお勧めしません)

サンプルのラベル:グループ+複製EG A1、A2、A3; B1、B2、B3。

出荷:

1。ドライアイス:サンプルをバッグに詰め、ドライアイスに埋める必要があります。

2。RNASTABLEチューブ:RNAサンプルは、RNA安定化チューブ(RNastable®など)で乾燥させ、室温で出荷できます。

サービスワークフロー

サンプルQC

実験設計

サンプル配信

サンプル配信

パイロット実験

RNA抽出

図書館の準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

販売サービス後

アフターセールサービス


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    RNA発現の概要

     

     图片41

    差次的に発現した遺伝子

     

    图片42

     

     

    CERNA分析

    图片43          差次的に発現したmiRNAおよび関連RNA

    图片44 

     キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、Bmkgeneの全体的なトランスクリプトームシーケンスサービスによって促進された研究の進歩を探ります。

     

    Dai、Y。etal。 (2022)「RNAシーケンスによって特定されたカシンベック病におけるmRNA、lncrNA、およびmiRNAの包括的な発現プロファイル」、Molecular omics、18(2)、pp。154–166。 doi:10.1039/d1mo00370d。

    Liu、N。Nanet al。 (2022)「越冬期間中のチャンバイ山のApis ceranaの冷たい耐性の全長トランスクリプトーム分析。」、Gene、830、pp。146503–146503。 doi:10.1016/j.gene.2022.146503。

    Wang、XJ et al。 (2022)「小細胞肺癌における競合する内因性RNA調節ネットワークのマルチオミクス統合ベースの優先順位付け:分子特性と薬物候補」、腫瘍学のフロンティア、12、p。 904865。doi:10.3389/fonc.2022.904865/bibtex。

    Xu、P。etal。 (2022) 'lncRNA/circrna-miRNA-mRNA発現プロファイルの統合分析は、ピーナッツの根ひまら線虫に応答した潜在的なメカニズムに対する新しい洞察を明らかにします」、BMCゲノミクス、23(1)、pp。1–12。 doi:10.1186/s12864-022-08470-3/fugures/7。

    Yan、Z。et al。 (2022)「全トランスクリプトームRNAシーケンスは、赤いLED照射によるブロッコリーの収穫後品質の維持に関連する分子メカニズムを強調しています」、収穫後生物学および技術、188、p。 111878。doi:10.1016/j.poshervbio.2022.111878。

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