●完全なトランスクリプトームをシーケンスするデュアルライブラリ:RRNAの枯渇に続いてPE150ライブラリの準備とサイズの選択に続いてSE50ライブラリの準備
●個別のバイオインフォマティクスレポートにおけるmRNA、lncrNA、circrNA、およびmiRNAの完全なバイオインフォマティクス分析
●CERNAネットワーク分析を含む複合レポートにおけるすべてのRNA発現の共同分析。
●規制ネットワークの詳細な分析:CERNAネットワーク分析は、mRNA、lncRNA、CircrNA、およびmiRNAの共同シーケンスと、徹底的なバイオインフォマティックワークフローによって有効になります。
●包括的な注釈:複数のデータベースを使用して、差次的に発現した遺伝子(deg)に機能的に注釈を付け、対応する濃縮分析を実行し、トランスクリプトーム応答の根底にある細胞および分子プロセスに関する洞察を提供します。
●広範な専門知識:さまざまな研究領域で2100以上のトランスクリプトームプロジェクトを閉鎖するという実績により、私たちのチームはすべてのプロジェクトに豊富な経験をもたらします。
●厳密な品質管理:サンプルやライブラリの準備からシーケンスやバイオインフォマティクスまで、すべての段階にわたってコア制御ポイントを実装します。この綿密な監視により、一貫して高品質の結果が得られます。
●販売後のサポート:私たちのコミットメントは、3か月の販売後のサービス期間でプロジェクトの完了を超えています。この間、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、およびQ&Aセッションを提供して、結果に関連するクエリに対処します
図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
RRNAが枯渇しました | イルミナPE150 | 16ギガバイト | Q30≥85% |
選択されたサイズ | イルミナSE50 | 10-20mの読み取り |
ヌクレオチド:
conc。(ng/μl) | 量(μg) | 純度 | 誠実さ |
≥80 | ≥1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 ゲルに示されているタンパク質またはDNAの汚染が限られているか、DNAの汚染がない。 | RIN以上の6.0 5.0≥28s/18S≥1.0; ベースラインの標高が制限されていないか、なし |
コンテナ:2 ml遠心分離機チューブ(スズ箔はお勧めしません)
サンプルのラベル:グループ+複製EG A1、A2、A3; B1、B2、B3。
出荷:
1。ドライアイス:サンプルをバッグに詰め、ドライアイスに埋める必要があります。
2。RNASTABLEチューブ:RNAサンプルは、RNA安定化チューブ(RNastable®など)で乾燥させ、室温で出荷できます。
バイオインフォマティクス
RNA発現の概要
差次的に発現した遺伝子
CERNA分析
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、Bmkgeneの全体的なトランスクリプトームシーケンスサービスによって促進された研究の進歩を探ります。
Dai、Y。etal。 (2022)「RNAシーケンスによって特定されたカシンベック病におけるmRNA、lncrNA、およびmiRNAの包括的な発現プロファイル」、Molecular omics、18(2)、pp。154–166。 doi:10.1039/d1mo00370d。
Liu、N。Nanet al。 (2022)「越冬期間中のチャンバイ山のApis ceranaの冷たい耐性の全長トランスクリプトーム分析。」、Gene、830、pp。146503–146503。 doi:10.1016/j.gene.2022.146503。
Wang、XJ et al。 (2022)「小細胞肺癌における競合する内因性RNA調節ネットワークのマルチオミクス統合ベースの優先順位付け:分子特性と薬物候補」、腫瘍学のフロンティア、12、p。 904865。doi:10.3389/fonc.2022.904865/bibtex。
Xu、P。etal。 (2022) 'lncRNA/circrna-miRNA-mRNA発現プロファイルの統合分析は、ピーナッツの根ひまら線虫に応答した潜在的なメカニズムに対する新しい洞察を明らかにします」、BMCゲノミクス、23(1)、pp。1–12。 doi:10.1186/s12864-022-08470-3/fugures/7。
Yan、Z。et al。 (2022)「全トランスクリプトームRNAシーケンスは、赤いLED照射によるブロッコリーの収穫後品質の維持に関連する分子メカニズムを強調しています」、収穫後生物学および技術、188、p。 111878。doi:10.1016/j.poshervbio.2022.111878。