全ゲノムビスルフィッテシーケンス（WGB）
全ゲノムビスル酸塩シーケンス（WGBS）は、DNAメチル化の詳細な調査のための金標準的な方法論として、特に遺伝子発現および細胞活性の極めて重要な調節因子であるシトシン（5-mc）の5番目の位置として存在します。基礎となるWGBSの原理は、ビスライト処理を伴い、メチル化シトシンを変化させずに、メチル化したシトシン（CからU）への変換を誘導します。この手法は、単一塩基の解像度を提供し、研究者はメチロームを包括的に調査し、さまざまな状態、特に癌に関連する異常なメチル化パターンを明らかにすることができます。 WGBを採用することにより、科学者はゲノム全体のメチル化環境に関する比類のない洞察を得ることができ、多様な生物学的プロセスと疾患の根底にあるエピジェネティックなメカニズムの微妙な理解を提供します。
サービス機能
●参照ゲノムが必要です。
●ラムダDNAが追加されて、ビスライト変換効率を監視します。
●Illumina Novaseqでのシーケンス。
サービスの利点
●DNAメチル化研究のゴールドスタンダード：この成熟したメチル化変換プロセシングテクノロジーは、高精度と良好な再現性を備えています。
●ワイドカバレッジとシングルベース解像度：ゲノム全体のレベルでのメチル化部位の検出。
●完全なプラットフォーム：サンプル処理、ライブラリの構築、シーケンスからバイオインフォマティクス分析までのワンストップサービスを提供します。
●広範な専門知識：WGBSシーケンスプロジェクトが多様な種類の種にわたって正常に完了したため、BMKGeneは10年以上の経験、高度なスキルのある分析チーム、包括的なコンテンツ、優れたポストセールスサポートをもたらします。
●トランスクリプトミクス分析に参加する可能性：RNA-seqなどの他のOMICSデータとWGBの統合分析を許可します。
サンプル仕様
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ出力 | 品質管理 |
| 処理された胆汁産生 | イルミナPE150 | 深さ30倍 | Q30≥85％ 塩水変換> 99％ |
サンプル要件
| 濃度（ng/µL） | 総量（µg） | 追加の要件 | |
| ゲノムDNA | ≥5 | 400 ng以上 | 限られた分解または汚染 |
サービスワークフロー
サンプル配信
DNA抽出
図書館の建設
シーケンス
データ分析
データ配信
次の分析を含めます。
●生のシーケンス品質制御。
●ゲノムを参照するためのマッピング。
●5MCメチル化塩基の検出。
●メチル化分布と注釈の分析。
●差次的にメチル化された領域（DMR）の分析。
●DMRに関連する遺伝子の機能的注釈。
5MCメチル化検出：メチル化部位の種類
メチル化マップ。 5MCメチル化ゲノム全体の分布
高度にメチル化された領域の注釈
差次的にメチル化された領域：関連遺伝子
差次的にメチル化された領域：関連する遺伝子の注釈（遺伝子オントロジー）
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、Bmkgeneの全ゲノムビスル酸塩シーケンスサービスによって促進された研究の進歩を探ります。
ファン、Y。etal。 （2020）「全ゲノム亜硫酸塩シーケンスを使用したヒツジ骨格筋発達中のDNAメチル化プロファイルの分析」、BMCゲノミクス、21（1）、pp。1–15。 doi：10.1186/s12864-020-6751-5。
Zhao、X。etal。 （2022）「塩化ビニルにさらされた労働者の新規デオキシリボ核酸メチル化摂動」、毒物学と産業の健康、38（7）、pp。377–388。 doi：10.1177/07482337222098600
Zuo、J。etal。 （2020）「ゲノムメチル化、非コードRNAのレベル、熟成トマトフルーツにおけるMRNA、代謝産物の関係」、植物ジャーナル、103（3）、pp。980–994。 doi：10.1111/tpj.14778。
