原核生物RNAシーケンス
特徴
●RNAサンプル処理には、RRNAの枯渇に続いて方向RNAライブラリーの調製が含まれます。
●参照ゲノムへのアライメントに基づくバイオインフォマティック分析
●分析には、遺伝子発現とdegだけでなく、転写構造とSRNA分析も含まれます
サービスの利点
●厳密な品質管理：サンプルやライブラリの準備からシーケンスやバイオインフォマティクスまで、すべての段階にわたってコア制御ポイントを実装します。この綿密な監視により、一貫して高品質の結果が得られます。
●ストランド固有のシーケンスデータ：RNAライブラリーの準備が方向性であるため、防止転写産物の識別が可能です。
●原核生物のトランスクリプトームに合わせた完全な分析：バイオインフォマティックパイプラインには、遺伝子発現の分析だけでなく、オペロン、UTR、プロモーターの識別を含む転写構造の分析も含まれます。また、SRNAの分析、すなわち、注釈と二次構造とターゲットの予測も含まれます。
●販売後のサポート：私たちのコミットメントは、3か月の販売後のサービス期間でプロジェクトの完了を超えています。この間、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、およびQ＆Aセッションを提供して、結果に関連するクエリに対処します。
サンプル要件と配信
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
| rRNA枯渇方向ライブラリ | イルミナPE150 | 1-2 GB | Q30≥85％ |
サンプル要件：
| conc。（ng/μl） | 量（μg） | 純度 | 誠実さ |
| ≥50 | ≥1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 ゲルに示されているタンパク質またはDNAの汚染が限られているか、DNAの汚染がない。 | RIN以上の6.5 |
推奨サンプル配信
コンテナ：2 ml遠心分離機チューブ（スズ箔はお勧めしません）
サンプルのラベル：グループ+複製EG A1、A2、A3; B1、B2、B3。
出荷：
1。ドライアイス：サンプルをバッグに詰め、ドライアイスに埋める必要があります。
2。RNASTABLEチューブ：RNAサンプルは、RNA安定化チューブ（RNastable®など）で乾燥させ、室温で出荷できます。
サービスワークフロー
サンプル配信
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターセールサービス
バイオインフォマティック分析ワークフロー
次の分析を含めます。
●生データ品質の制御
●参照ゲノムへのアラインメント
●ライブラリの品質評価：RNAの断片化のランダム性、挿入サイズ、シーケンス飽和
●予測されたコーディング遺伝子の機能的注釈
●式分析：相関および主成分分析（PCA）
●微分遺伝子発現（degs）
●機能的な注釈とDEGの濃縮
●SRNA分析：予測、注釈、ターゲット、および二次構造予測
●転写構造分析：オペロン、開始位置と終了位置、翻訳されていない領域（UTS）、プロモーター、およびSNP/インデル分析
シーケンス飽和
コード遺伝子の機能的注釈
サンプル間の相関
微分発現遺伝子（degs）分析
機能的濃縮分析
sRNAアノテーション
この特徴の出版物で、BmkgeneのナノポアフルレングスmRNAシーケンスサービスによって促進された進歩を探ります。
グアン、CP等。 （2018）「ソフォレア脱毛症の総アルカロイドに反応するバイオフィルム形成のブリオフィルコッカス表皮のグローバルなトランスクリプトームの変化」、微生物学のポーランドジャーナル、67（2）、p。 223。DOI：10.21307/PJM-2018-024。
