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BMKMANU S3000_空間トランスクリプトーム
空間トランスクリプトミクスは科学革新の最前線にあり、研究者が空間的コンテキストを維持しながら組織内の複雑な遺伝子発現パターンを詳しく調査できるようにします。さまざまなプラットフォームがある中、BMKGene は BMKManu S3000 空間トランスクリプトーム チップを開発しました。これは 3.5 µm の強化された解像度を誇り、細胞以下の範囲に達し、マルチレベルの解像度設定が可能です。約 400 万個のスポットを備えた S3000 チップは、空間的にバーコード化された捕捉プローブをロードしたビーズが積層されたマイクロウェルを採用しています。空間バーコードが豊富な cDNA ライブラリーは S3000 チップから調製され、その後 Illumina NovaSeq プラットフォームで配列決定されます。空間的にバーコード化されたサンプルと UMI を組み合わせることで、生成されるデータの精度と特異性が保証されます。 BMKManu S3000 チップは非常に多用途で、さまざまな組織や必要な詳細レベルに合わせて微調整できるマルチレベルの解像度設定を提供します。この適応性により、このチップは多様な空間トランスクリプトミクス研究に優れた選択肢として位置づけられ、ノイズを最小限に抑えた正確な空間クラスタリングが保証されます。 BMKManu S3000 で細胞セグメンテーション技術を使用すると、転写データを細胞の境界まで区切ることができ、直接的な生物学的意味を持つ分析が可能になります。さらに、S3000 の解像度の向上により、細胞ごとに検出される遺伝子と UMI の数が増加し、空間転写パターンと細胞のクラスター化をより正確に分析できるようになります。
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単核 RNA シーケンス
単一細胞捕捉およびカスタム ライブラリ構築技術の開発と、ハイスループット シーケンスの組み合わせにより、細胞レベルでの遺伝子発現研究に革命が起こりました。このブレークスルーにより、複雑な細胞集団のより深くより包括的な分析が可能になり、すべての細胞にわたる遺伝子発現の平均化に関連する制限が克服され、これらの集団内の真の不均一性が維持されます。単一細胞 RNA シーケンス (scRNA-seq) には否定できない利点がありますが、特定の組織では単一細胞懸濁液の作成が困難であり、新鮮なサンプルが必要であるという課題に直面しています。 BMKGene では、最先端の 10X Genomics Chromium テクノロジーを使用した単核 RNA シーケンス (snRNA-seq) を提供することで、このハードルに対処しています。このアプローチにより、単一細胞レベルでのトランスクリプトーム解析が可能なサンプルの範囲が広がります。
核の単離は、二重交差を備えた 8 チャンネルのマイクロ流体システムを備えた革新的な 10X Genomics Chromium チップによって実現されます。このシステム内では、バーコード、プライマー、酵素、および単一の核を組み込んだゲルビーズがナノリットルサイズの油滴にカプセル化され、ゲルビーズインエマルジョン（GEM）を形成します。 GEM の形成後、各 GEM 内で細胞の溶解とバーコードの放出が行われます。続いて、mRNA 分子は cDNA に逆転写され、10X バーコードと Unique Molecular Identifier (UMI) が組み込まれます。これらの cDNA は標準的な配列決定ライブラリー構築に供され、単一細胞レベルでの遺伝子発現プロファイルの堅牢かつ包括的な探索が容易になります。
プラットフォーム: 10× Genomics Chromium および Illumina NovaSeq プラットフォーム
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10x Genomics Visium 空間トランスクリプトーム
空間トランスクリプトミクスは、研究者が空間的コンテキストを維持しながら組織内の遺伝子発現パターンを調査できるようにする最先端の技術です。この分野の強力なプラットフォームの 1 つは、Illumina シーケンスと組み合わせた 10x Genomics Visium です。 10X Visium の原理は、組織切片が配置される指定されたキャプチャ領域を備えた特殊なチップ上にあります。この捕捉領域にはバーコード化されたスポットが含まれており、それぞれが組織内の固有の空間位置に対応しています。組織から捕捉された RNA 分子は、逆転写プロセス中に固有の分子識別子 (UMI) で標識されます。これらのバーコード付きスポットと UMI により、単一細胞解像度での遺伝子発現の正確な空間マッピングと定量化が可能になります。空間的にバーコード化されたサンプルと UMI を組み合わせることで、生成されるデータの精度と特異性が保証されます。この空間トランスクリプトミクス技術を使用することで、研究者は細胞の空間構成や組織内で起こる複雑な分子相互作用をより深く理解できるようになり、腫瘍学、神経科学、発生生物学、免疫学などの複数の分野における生物学的プロセスの基礎となるメカニズムについて貴重な洞察を得ることができます。 、植物の研究。
プラットフォーム: 10X Genomics Visium および Illumina NovaSeq
