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BMKMANU S3000_空間トランスクリプトーム
空間トランスクリプトミクスは科学革新の最前線にあり、研究者が空間的コンテキストを維持しながら組織内の複雑な遺伝子発現パターンを詳しく調査できるようにします。さまざまなプラットフォームがある中、BMKGene は BMKManu S3000 空間トランスクリプトーム チップを開発しました。これは 3.5 µm の強化された解像度を誇り、細胞以下の範囲に達し、マルチレベルの解像度設定が可能です。約 400 万個のスポットを備えた S3000 チップは、空間的にバーコード化された捕捉プローブをロードしたビーズが積層されたマイクロウェルを採用しています。空間バーコードが豊富な cDNA ライブラリーは S3000 チップから調製され、その後 Illumina NovaSeq プラットフォームで配列決定されます。空間的にバーコード化されたサンプルと UMI を組み合わせることで、生成されるデータの精度と特異性が保証されます。 BMKManu S3000 チップは非常に多用途で、さまざまな組織や必要な詳細レベルに合わせて微調整できるマルチレベルの解像度設定を提供します。この適応性により、このチップは多様な空間トランスクリプトミクス研究に優れた選択肢として位置づけられ、ノイズを最小限に抑えた正確な空間クラスタリングが保証されます。 BMKManu S3000 で細胞セグメンテーション技術を使用すると、転写データを細胞の境界まで区切ることができ、直接的な生物学的意味を持つ分析が可能になります。さらに、S3000 の解像度の向上により、細胞ごとに検出される遺伝子と UMI の数が増加し、空間転写パターンと細胞のクラスター化をより正確に分析できるようになります。
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DNBSEQ 既製ライブラリ
MGI が開発した DNBSEQ は、シーケンスコストをさらに削減し、スループットを向上させる革新的な NGS テクノロジーです。 DNBSEQ ライブラリーの調製には、DNA 断片化、ssDNA の調製、および DNA ナノボール (DNB) を取得するためのローリングサークル増幅が含まれます。これらは固体表面にロードされ、その後コンビナトリアル プローブ アンカー合成 (cPAS) によって配列決定されます。 DNBSEQ テクノロジーは、低い増幅エラー率とナノボールによる高密度エラー パターンの使用という利点を組み合わせ、より高いスループットと精度のシーケンスを実現します。
当社の既製ライブラリーシーケンスサービスを利用すると、お客様はさまざまなソース (mRNA、全ゲノム、アンプリコン、10x ライブラリーなど) からイルミナシーケンシングライブラリーを準備できます。これらは当社の研究室で MGI ライブラリーに変換され、DNBSEQ-T7 でシーケンスされるため、低コストで大量のデータを実現します。
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Hi-Cベースのクロマチン相互作用
Hi-C は、プロービング近接ベースの相互作用とハイスループット シーケンスを組み合わせてゲノム構成を捕捉するように設計された方法です。この方法は、ホルムアルデヒドによるクロマチン架橋に基づいており、その後、共有結合した断片のみがライゲーション産物を形成するような方法での消化と再ライゲーションが続きます。これらのライゲーション産物を配列決定することにより、ゲノムの 3D 構成を研究することができます。 Hi-C を使用すると、軽く詰まっていて転写活性が高い可能性が高いゲノム部分 (A コンパートメント、ユークロマチン) と、より密に詰まっている領域 (B コンパートメント、ヘテロクロマチン) の分布を研究することができます。 Hi-C は、折り畳まれた構造を持ち、同様の発現パターンを持つ可能性が高いゲノム領域であるトポロジー関連ドメイン (TAD) を正確に特定したり、タンパク質によって互いに固定されている DNA 領域であるクロマチン ループを特定したりするためにも使用できます。多くの場合、規制要素が豊富に含まれています。 BMKGene の Hi-C シーケンス サービスを利用すると、研究者はゲノムの空間的側面を探索できるようになり、ゲノム制御とその健康と疾患への影響を理解するための新たな道が開かれます。
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TGuide スマート磁気植物 RNA キット
TGuide スマート磁気植物 RNA キット
植物組織から高品質のトータル RNA を精製
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TGuide スマート血液/細胞/組織 RNA キット
TGuide スマート血液/細胞/組織 RNA キット
動物組織/細胞/新鮮な全血から高収量、高純度、高品質、阻害剤フリーのトータル RNA を精製するためのプレフィルド カートリッジ/プレート試薬キット
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TGuide スマート磁気植物 DNA キット
TGuide スマート磁気植物 DNA キット
さまざまな植物組織から高品質のゲノム DNA を精製
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TGuide スマート土壌/糞便 DNA キット
TGuide スマート土壌/糞便 DNA キット
土壌および糞便サンプルから阻害剤を含まない高純度かつ高品質の DNA を精製します
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TGuide スマート DNA 精製キット
PCR産物またはアガロースゲルから高品質のDNAを回収します。
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TGuide スマート血液ゲノム DNA キット
TGuide スマート血液ゲノム DNA キット
血液およびバフィーコートからゲノム DNA を精製するための充填済みカートリッジ/プレート試薬キット
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TGuide スマート磁気組織 DNA キット
動物組織からゲノム DNA を抽出するための充填済みカートリッジ/プレート試薬キット
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TGuide スマート ユニバーサル DNA キット
血液、乾燥血痕、細菌、細胞、唾液、口腔綿棒、動物組織などからゲノム DNA を精製するための充填済みカートリッジ/プレート試薬キット。
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TGuide S16 核酸抽出装置
TGuide S16 核酸抽出装置
使いやすいベンチトップ機器、同時に 1 ～ 8 または 16 個のサンプル
カタログ番号/パッケージ
猫。いいえ
ID
準備数
OSE-S16-AM
1セット
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PacBio 2+3 全長 mRNA ソリューション
NGS ベースの mRNA シーケンスは遺伝子発現を定量化するための多用途ツールですが、ショートリードに依存しているため、複雑なトランスクリプトーム解析における有効性は制限されます。一方、PacBio シーケンス (Iso-Seq) はロングリード技術を採用しており、全長 mRNA 転写物のシーケンスを可能にします。このアプローチは、遺伝子発現定量化の主な選択肢ではありませんが、選択的スプライシング、遺伝子融合、およびポリアデニル化の包括的な探索を容易にします。 2+3 の組み合わせは、転写アイソフォームの完全なセットを識別するための PacBio HiFi リードと同一のアイソフォームを定量化するための NGS シーケンシングに依存することで、イルミナと PacBio の間のギャップを埋めます。
プラットフォーム: PacBio Sequel II/PacBio Revio および Illumina NovaSeq。
