Pacbio 全長トランスクリプトーム

PacBio 全長トランスクリプトーム シーケンシング (Isoseq) は、転写物アイソフォームの正確な同定を可能にし、選択的ポリアデニル化とスプライシングに光を当て、より正確な遺伝子発現解析につながります。 BMKCloud PacBio 全長トランスクリプトーム パイプラインは、サーキュラー コンセンサス シーケンシング (CCS) モードで配列決定された cDNA ライブラリを分析し、全長非キメラ (FLNC) 配列を識別し、非重複転写物にクラスター化するように設計されています。その後の BUSCO 分析により、トランスクリプトーム アセンブリの完全性が評価されます。組み立てられたトランスクリプトームから、選択的スプライシング、単純配列リピート (SSR)、lncRNA と対応する標的遺伝子の予測、新規遺伝子の予測、遺伝子ファミリー分析、転写因子分析、転写産物の機能的アノテーションなど、複数の分析が実行されます。