mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA シーケンスにより、特定の条件下で細胞内​​のすべての mRNA 転写物のプロファイリングが可能になり、さまざまな研究分野で広く使用されている技術です。 BMKCloud De novo mRNA-seq パイプラインは、参照ゲノムが利用できない場合に、ポリ A が豊富なシーケンス ライブラリを分析するように設計されています。パイプラインは品質管理から始まり、次にデノボ転写産物のアセンブリと単一遺伝子セットの選択。ユニジーン構造解析により、コード配列 (CDS) と単純配列反復 (SSR) が予測されます。続いて、示差的発現解析により、テストした条件間で示差的に発現された遺伝子 (DEG) が見つかり、続いて機能的アノテーションと DEG の強化が行われ、生物学的洞察が抽出されます。