ゲノム全体の関連分析
ワークフロー
サービスの利点
●広範な専門知識と出版記録：GWASでの累積経験により、Bmkgeneは人口GWAS研究の数百の種プロジェクトを完了し、研究者が100以上の記事を公開するのを支援し、累積衝撃因子は500に達しました。
●包括的なバイオインフォマティクス分析：ワークフローには、SNP-trat Association分析が含まれ、候補遺伝子のセットとそれに対応する機能注釈を提供します。
●高度に熟練したバイオインフォマティクスチームと短い分析サイクル：Advanced Genomics分析の素晴らしい経験により、BMKGENEのチームは、迅速なターンアラウンドタイムで包括的な分析を提供します。
●販売後のサポート：私たちのコミットメントは、3か月の販売後のサービス期間でプロジェクトの完了を超えています。この間、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、およびQ＆Aセッションを提供して、結果に関連するクエリに対処します。
サービスの仕様と要件
| シーケンスのタイプ | 推奨される人口スケール | シーケンス戦略 | ヌクレオチド要件 |
| 全ゲノムシーケンス | 200のサンプル | 10x | 濃度：≥1ng/ µL 総額30ng以上 限られたまたは劣化または汚染なし |
| 特定のロカス増幅フラグメント（SLAF） | タグ深度：10x タグの数： <400 MB：WGSをお勧めします <1GB：100Kタグ 1GB > 2GB：300Kタグ 最大500Kタグ | 濃度≥5ng/µL 総額8 ng以上 Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 アガロースゲル：劣化または汚染はありません
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材料の選択
さまざまな種類、亜種、陸上骨/ゼネバンクス/混合家族/野生資源
さまざまな品種、亜種、陸屋
ハーフシブファミリー/フルシブファミリー/野生リソース
サービスワークフロー
実験設計
サンプル配信
RNA抽出
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターセールサービス
次の分析を含めます。
- ゲノム全体の関連分析：LM、LMM、EMMAX、FASTLMMモデル
- 候補遺伝子の機能的注釈
SNP-TRAIT Association Analysis - マンハッタンプロット
SNP-TRAIT Association Analysis - QQプロット
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、BmkgeneのDe Gwasサービスによって促進された進歩を探ります。
LV、L。etal。 （2023）「ゲノム全体の関連研究によるカミソリの耐性の遺伝的基盤への洞察」養殖、569、p。 739351。doi：10.1016/j.aquaculture.2023.739351。
Li、X。etal。 （2022） '398個のフォクステールキビの吹き込みのマルチオミクス分析は、家畜化、代謝産物の特性、抗炎症効果に関連するゲノム領域を明らかにしています」、分子植物、15（8）、pp。1367–1383。 doi：10.1016/j.molp.2022.07.003。
Li、J。etal。 （2022）「干ばつ環境におけるかろうじて表現型のゲノムワイドな関連性のマッピング」、植物科学のフロンティア、13、p。 924892。doi：10.3389/fpls.2022.924892/bibtex。
Zhao、X。etal。 （2021） 'スルホトランスフェラーゼをコードするGMST1は、大豆モザイクウイルス株G2およびG3に対する耐性を付与します。植物、セル、環境、44（8）、pp。2777–2792。 doi：10.1111/pce.14066。
