真核生物の mRNA シーケンス - NGS
特徴
● ライブラリー調製前のポリ mRNA の捕捉
● 鎖特異的な配列データの取得を可能にするオプションの方向性 mRNA ライブラリー調製
● 遺伝子発現と転写構造のバイオインフォマティクス分析
利点
●幅広い専門知識: 私たちのチームは、BMKgene で細胞培養、組織、体液などのさまざまな種類のサンプルを含む 600,000 を超えるサンプルを処理してきました。当社はあらゆるプロジェクトに豊富な経験をもたらし、さまざまな研究領域で 100,000 を超える mRNA-Seq プロジェクトを成功させてきました。
●厳格な品質管理: 私たちは、サンプルとライブラリーの調製からシーケンスとバイオインフォマティクスに至るまで、すべての段階にわたってコア管理ポイントを実装します。この細心の注意を払って監視することで、一貫して高品質の結果が確実に提供され、プロジェクトが信頼できる手に委ねられることが保証されます。
●包括的な注釈: 私たちは複数のデータベースを使用して、Differentially Expressed Genes (DEG) に機能的なアノテーションを付け、対応するエンリッチメント分析を実行します。この包括的なアプローチにより、トランスクリプトーム応答の根底にある細胞および分子プロセスについての洞察が得られ、プロジェクトの結果について十分な情報が得られるようになります。
●販売後のサポート: 当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、および結果に関する質問に対処する Q&A セッションを提供します。
サンプルの要件と納品
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
| ポリAが豊富 | イルミナPE150 DNBSEQ-T7 | 6～10GB | Q30≧85% |
サンプル要件:
ヌクレオチド:
| 濃度(ng/μl) | 量（μg） | 純度 | 誠実さ | |
| 標準ライブラリ | ≥ 10 | ≧ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5～2.5 ゲル上にタンパク質や DNA の汚染はほとんど見られないか、まったく見られません。 | 植物の場合: RIN≥4.0。 動物の場合：RIN≧4.5。 5.0≧28S/18S≧1.0; 基準高度が限られているか、基準高度がない |
| 方向性ライブラリ | ≥ 10 | ≧ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5～2.5 ゲル上にタンパク質や DNA の汚染はほとんど見られないか、まったく見られません。 | 植物の場合: RIN≥4.0。 動物の場合：RIN≧4.5。 5.0≧28S/18S≧1.0; 基準高度が限られているか、基準高度がない |
● 植物:
根、茎または花びら: 450 mg
葉または種子: 300 mg
果実：1.2g
●動物：
心臓または腸: 300 mg
内臓または脳: 240 mg
筋肉：450mg
骨、髪、皮膚：1g
● 節足動物:
昆虫：6g
甲殻類：300mg
●全血: 1チューブ
● セル：106 細胞
推奨されるサンプル配信
容器: 2 ml 遠沈管 (錫箔は推奨しません)
ラベル付けのサンプル: グループ + 複製 (A1、A2、A3 など)。 B1、B2、B3……
出荷:
1. ドライアイス: サンプルを袋に詰めてドライアイスに埋める必要があります。
2. RNA テーブル チューブ: RNA サンプルは RNA 安定化チューブ (例: RNAstable®) 内で乾燥され、室温で出荷されます。
サービスのワークフロー
実験計画
サンプル納品
RNA抽出
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
バイオインフォマティクス
真核生物 mRNA シーケンス解析のワークフロー
バイオインフォマティクス
Ø生データの品質管理
Ø参照ゲノムのアライメント
Ø転写物構造解析
Ø発現の定量化
Ø発現差解析
Ø関数のアノテーションとエンリッチメント
参照ゲノムのアライメント
データの飽和
生物学的複製のサンプル相関と評価
差次的発現遺伝子 (DEG)
DEG の機能アノテーション
DEGの機能強化
厳選された出版物コレクションを通じて、BMKGene の真核生物 NGS mRNA シーケンス サービスによって促進された進歩を探ってください。
Huang、L.ら。 (2023) 「トリクロサンとトリクロカルバンは、臭気物質の認識を抑制し、嗅覚シグナル伝達を妨害し、嗅覚情報処理を妨害することにより、金魚の嗅覚能力を弱めます」、Water Research、233、p. 119736. 土井: 10.1016/J.WATRES.2023.119736。
ジア、LJ 他(2023) 「アスペルギルス フミガタスはヒト p11 をハイジャックして、真菌を含むファゴソームを非分解経路にリダイレクトする」、Cell Host & Microbe、31(3)、pp. 373-388.e10。土井: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002。
Jin, K. et al. (2022) 「マ竹 (Dendrocalamus latiflorus Munro) のシュートの発達に関与する TCP 転写因子」、植物科学のフロンティア、13、p. 884443.doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX。
ウェン、Ｘら。 (2022) 「Chrysanthemum lavandulifolium ゲノムと多様な頭蓋型の基礎となる分子機構」、Horticulture Research、9. doi: 10.1093/HR/UHAB022。
Zhang、Yujieら。 (2023) 「相乗的な ROS 増強とオートファジー遮断を介して結腸直腸癌に対する音響力学療法を強化するためのカスケード ナノリアクター」、Nano Today、49、p. 101798. 土井: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
