DNBSEQ 既成ライブラリ
特徴
●プラットフォーム:MGI-DNBSEQ-T7
●シーケンスモード:PE150
●Illumina ライブラリの移転MGI:低コストで大量のデータのシーケンス処理を可能にします。
●シーケンス前のライブラリの品質管理。
●シーケンスデータの QC と納品:Q30 読み取りを逆多重化およびフィルタリングした後、QC レポートと生データを fastq 形式で配信します。
利点
●シーケンス サービスの多用途性:顧客はレーンまたはデータ量ごとに順序を選択できます。
●高いデータ出力:1500GB/レーン
●シーケンス QC レポートの提供:高品質のメトリクス、データの精度、シーケンスプロジェクトの全体的なパフォーマンスを実現します。
●成熟したシーケンスプロセス:短い所要時間で。
●厳格な品質管理: 一貫して高品質な結果の提供を保証するために、厳格な QC 要件を実装しています。
サンプル要件
| データ量(X) | 濃度 (qPCR/nM) | 音量 | |
| パーシャルレーン
| X ≤ 10GB | ≥ 1nM | 25μl以上 |
| 10GB < X ≤ 50GB | ≧ 2nM | 25μl以上 | |
| 50GB < X ≤ 100GB | ≧ 3nM | 25μl以上 | |
| X > 100GB | ≧ 4 nM | ||
| 単車線 | レーンごと | ≥ 1.5 nM / ライブラリープール | ≥ 25 μl / ライブラリープール |
濃度と総量に加えて、適切なピークパターンも必要です。
注: 低多様性ライブラリのレーン シーケンスでは、堅牢なベース コールを確保するために PhiX スパイクインが必要です。
事前にプールされたライブラリをサンプルとして提出することをお勧めします。 BMKGENE でライブラリ プーリングを実行する必要がある場合は、「
部分的なレーン シーケンスのライブラリ要件。
ライブラリのサイズ (ピークマップ)
メインピークは 300 ～ 450 bp 以内である必要があります。
ライブラリには単一のメインピークがあり、アダプターの汚染やプライマーダイマーがないことが必要です。
サービスのワークフロー
図書館QCレポート
ライブラリーの品質に関するレポートは、シーケンス、ライブラリー量の評価、および断片化の前に提供されます。
シーケンスQCレポート
表 1. シーケンス データの統計。
| サンプルID | BMKID | 生の読み取り | 生データ (bp) | クリーンリード (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
図 1. 各サンプルのリードに沿った品質分布
図 2. 基本コンテンツの配布
図 3. シーケンスデータ内の読み取り内容の分布
