●プラットフォーム:Illumina Novaseq 6000およびNovaseq X Plus
●シーケンスモード:PE150およびPE250
●シーケンス前のライブラリの品質管理
●データのシーケンスQCと配信:QCレポートとRAWデータの配信は、Q30の再評価とフィルタリング後のFastQ形式で読み取ります
●シーケンスサービスの汎用性:顧客は、レーン、フローセル、または必要なデータの量(部分レーンシーケンス)でシーケンスすることを選択できます。
●イルミナシーケンスプラットフォームでの豊富なエクスペリエンス:さまざまな種を持つ何千もの閉鎖プロジェクトがあります。
●シーケンスの配信QCレポート:品質メトリック、データの精度、およびシーケンスプロジェクトの全体的なパフォーマンスを備えています。
●成熟シーケンスプロセス:短いターンアラウンド時間で。
●厳密な品質管理:一貫した高品質の結果の提供を保証するために、厳格なQC要件を実装します。
プラットフォーム | フローセル | シーケンスモード | ユニット | 推定出力 |
novaseq x | 10b(8レーン) | PE150 | 単車線 部分レーン | 375GB /レーン |
25b(8レーン) | PE150 | 単車線 部分レーン | 1000 GB/レーン | |
novaseq 6000 | SPフローセル(2レーン) | PE250 | フローセル 単車線 部分レーン | 325-400 m Reads / Lane |
S4フローセル(4レーン) | PE150 | フローセル 単車線 部分レーン | 〜800 gb / lane |
データ額(x) | 濃度(QPCR/nm) | 音量 | |
部分レーンシーケンス
| x≤10gb | ≥1nm | ≥25μL |
10 GB <X≤50GB | 2 nm以上 | ≥25μL | |
50 GB <X≤100GB | ≥3nm | ≥25μL | |
x> 100 gb | 4 nm以上 | ≥25μL | |
レーンシーケンス | 車線ごと | ≥1.5nm /ライブラリプール | ≥25μL /ライブラリプール |
濃度と総量に加えて、適切なピークパターンも必要です。
注:低ダイバーシティライブラリのレーンシーケンスには、堅牢なベース呼び出しを確保するためにPhixスパイクインが必要です。
プールされたライブラリをサンプルとして提出することをお勧めします。ライブラリプーリングを実行するためにBMKGENEが必要な場合は、参照してください
部分レーンシーケンスのライブラリ要件。
メインピークは300〜450 BP以内にする必要があります。
ライブラリには、単一のメインピーク、アダプターの汚染なし、プライマーダイマーがない必要があります。
ライブラリの品質に関するレポートは、シーケンス、ライブラリの量の評価、断片化の前に提供されます。
表1。シーケンスデータに関する統計。
サンプルID | bmkid | 生の読み取り | 生データ(BP) | クリーンリード(%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
図1。各サンプルの読み取りに沿った品質分布
図2。ベースコンテンツの分布
図3。シーケンスデータにおける読み取りコンテンツの分布