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*ここに示されているデモの結果はすべて、Biomarker Technologiesで公開されたゲノムからのものです

1.LTR挿入時間推定：この図は、他の種と比較して、ライ麦ゲノムを除いてLTR-RTS挿入時間に一意のバイモーダル分布を示しました。最新のピークは約500万年前に登場しました。

Li Guang et al。、自然遺伝学、2021

2. Chayote（Sechium Edule）の系統発生と遺伝子ファミリー分析：Chayoteと遺伝子ファミリーの他の13の関連種を分析することにより、ChayoteはSnake Gourd（Trichosanthes Anguina）と最も密接に関連していることがわかった。約27-45 MYAのヘビのひょうたんに由来するチャヨーテと全ゲノム重複（WGD）は、25±4 MYAのChayoteで観察されました。

fu a et al。、園芸研究、2021

3.シンテニー分析：果物の発達における植物ホルモンに関連するいくつかの遺伝子が、Chayote、Snake Gourd、Schashで見つかりました。 ChayoteとSchashの相関は、ChayoteとSnake Gourdの相関よりもわずかに高くなっています。

fu a et al。、園芸研究、2021

4.遺伝子科の分析：G.thurberiおよびG.Davidsoniiゲノムの遺伝子ファミリーの拡大と収縮に関するKegg濃縮は、ステロイド生合成とブラジノステロイド生合成関連遺伝子が拡大したことを示しました。

Yang Z et al。、BMC生物学、2021

5.全体のゲノム重複分析：4DTVおよびKS分布分析では、全ゲノム重複イベントが示されています。重複イベントが示された種内のピーク。種間で示された種間イベントのピーク。分析は、他の3つの密接に関連する種と比較して、O。europaeaが最近大規模な遺伝子複製を経験したことを示しました。

Rao G et al。、園芸研究、2021

BMKケース

吐き気のないローズ：水分の適応に関連するゲノム洞察

公開： 全国科学レビュー、2021

シーケンス戦略：

'Basye'sとげのない'（R。ウィチュラナン）ゲノム：
約93 X Pacbio +約90 X Nanopore + 267 X Illumina

重要な結果

1.高品質のR.Wichuraianaゲノムは、長い読み取りシーケンス技術を使用して構築され、530.07 MBのアセンブリを生成しました（推定ゲノムサイズは、フローサイトメトリーで約525.9 MB、ゲノム調査で525.5は約1.03％でした）。 Buscoの推定スコアは93.9％でした。 「Old Blush」（Haploob）と比較して、このゲノムの品質と完全性は、ベースシングルベース精度とLTRアセンブリインデックス（LAI = 20.03）によって確認されました。 R.Wichuraianaゲノムには、32,674個のタンパク質コーディング遺伝子が含まれています。

2.比較ゲノミクス、トランスクリプトーム、遺伝集団のQTL分析で構成されるミルチオミクスの共同分析により、R。wichuraianaとRosa chinensisの間の重要な種分化が明らかになりました。また、QTLにおける関連遺伝子の発現変動は、STEMの吐き出しパターンと関連している可能性がありました。

Synteny分析、遺伝子ファミリークラスター、拡張、収縮分析など、Basye; S ThornlessとRosa Chinensisの間の比較ゲノミクスAnaysisは、バラの重要な特性に関連する多数のバリエーションを明らかにしました。 NACおよびFAR1/FRS遺伝子ファミリーのユニークな拡張は、ブラックスポットに対する耐性と関連している可能性が非常に高い。

Zhong、M.、et al。 「吐き気のないローズ：水分の適応に関連するゲノムの洞察」全国科学レビュー、2021;、nwab092。