●rRNA枯渇に続いて方向性ライブラリの準備が行われ、ストランド固有のシーケンスデータが可能になります。
●バイオインフォマティックワークフローにより、CIRCRNAの予測と発現の定量化が可能になります
●より包括的なRNAライブラリ:プレライブラリ準備では線形RNAの枯渇の代わりにrRNA枯渇を使用し、シーケンスデータにcircrNAだけでなくmRNAとlncRNAも含まれていることを確認し、これらのデータセットの共同分析を可能にします
●競合的内因性RNA(CERNA)ネットワークのオプション分析:細胞調節メカニズムに関するより深い洞察を提供します
●広範な専門知識:BMKGENEで20,000を超えるサンプルを処理した実績があり、多様なサンプルタイプとLNCRNAプロジェクトにまたがって、私たちのチームはすべてのプロジェクトに豊富な経験をもたらします。
●厳密な品質管理:サンプルやライブラリの準備からシーケンスやバイオインフォマティクスまで、すべての段階にわたってコア制御ポイントを実装します。この綿密な監視により、一貫して高品質の結果が得られます。
●販売後のサポート:私たちのコミットメントは、3か月の販売後のサービス期間でプロジェクトの完了を超えています。この間、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、およびQ&Aセッションを提供して、結果に関連するクエリに対処します。
図書館 | プラットフォーム | 推奨データ | データQC |
rRNA枯渇方向ライブラリ | イルミナPE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
conc。(ng/μl) | 量(μg) | 純度 | 誠実さ |
≥80 | ≥0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 ゲルに示されているタンパク質またはDNAの汚染が限られているか、DNAの汚染がない。 | RIN≥6.0; 5.0≥28s/18S≥1.0; ベースラインの標高が制限されていないか、なし |
●植物:
根、茎、または花びら:450 mg
葉または種子:300 mg
果物:1.2 g
●動物:
心臓または腸:450 mg
内臓または脳:240 mg
筋肉:600 mg
骨、髪、または肌:1.5g
●節足動物:
昆虫:9g
甲殻類:450 mg
●全血:2つのチューブ
●セル: 106 セル
●血清と血漿:6 ml
コンテナ:2 ml遠心分離機チューブ(スズ箔はお勧めしません)
サンプルのラベル:グループ+複製EG A1、A2、A3; B1、B2、B3。
出荷:
1。ドライアイス:サンプルをバッグに詰め、ドライアイスに埋める必要があります。
2。RNASTABLEチューブ:RNAサンプルは、RNA安定化チューブ(例えば、RNastable®)で乾燥させ、室温で出荷できます。
バイオインフォマティクス
CIRCRNA予測:染色体分布
差次的に発現したシルナ - 火山プロット
差次的に発現したシルナ - 階層クラスタリング
CircRNAの宿主遺伝子の機能的濃縮
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、BmkgeneのCircrnaシーケンスサービスによって促進された研究の進歩を探ります。
Wang、X。et al。 (2021)「CPSF4は、肝細胞癌におけるシルナ形成とマイクロRNA媒介遺伝子サイレンシングを調節します」、腫瘍遺伝子2021 40:25、40(25)、pp。4338–4351。 doi:10.1038/s41388-021-01867-6。
Xia、K。etal。 (2023)「X oo応答性トランスクリプトームは、イネにおけるオサラブの発現を調節することにより、疾患耐性における円形RNA133の役割を明らかにします」、植物病理学研究、5(1)、pp。1–14。 doi:10.1186/s42483-023-00188-8/figures/6。
Y、H。etal。 (2023)「CPSF3は、肝細胞癌における円形および線形転写産物のバランスを調節します」。 doi:10.21203/rs.3.rs-2418311/v1。
Zhang、Y。etal。 (2023)「肝臓移植前後の肝硬変心筋症における肝臓の包括的な評価」、国際免疫薬理学、114、p。 109495。doi:10.1016/j.intimp.2022.109495。