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条形バナー-03

製品

クロマチン免疫沈降シーケンス (ChIP-seq)

クロマチン免疫沈降 (CHIP) は、抗体を利用して DNA 結合タンパク質とそれに対応するゲノム標的を選択的に濃縮する技術です。 NGS との統合により、ヒストン修飾、転写因子、その他の DNA 結合タンパク質に関連する DNA ターゲットのゲノムワイドなプロファイリングが可能になります。この動的なアプローチにより、さまざまな細胞型、組織、または状態にわたる結合部位の比較が可能になります。 ChIP-Seq の応用範囲は、転写制御および発生経路の研究から疾患メカニズムの解明まで多岐にわたり、ゲノム制御の状況を理解し、治療上の洞察を進める上で不可欠なツールとなっています。

プラットフォーム: Illumina NovaSeq


サービス内容

バイオインフォマティクス

デモの結果

サービスのメリット

高度なバイオインフォマティクス分析と包括的なアノテーション:私たちは複数のデータベースを使用して、タンパク質と DNA の結合領域に関連する遺伝子に機能的な注釈を付け、相互作用の根底にある細胞および分子プロセスに関する洞察を提供します。

販売後のサポート:当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、および結果に関する質問に対処する Q&A セッションを提供します。

豊富な経験:数多くの ChIP-Seq プロジェクトを成功裡に完了してきた実績を持つ当社は、10 年以上にわたる専門知識をもたらします。当社の高度なスキルを持つ分析チームと包括的なコンテンツおよび販売後のサポートが、お客様のプロジェクトの成功を保証します。

●厳格な品質管理: 私たちは、サンプルとライブラリーの調製からシーケンスとバイオインフォマティクスに至るまで、すべての段階にわたってコア管理ポイントを実装します。この細心の注意を払って監視することで、一貫して高品質の結果が確実に提供されます。

サービス仕様

図書館

シーケンス戦略

推奨されるデータ出力

品質管理

免疫沈降後の精製DNA

イルミナPE150

10Gb

Q30≧85%

亜硫酸水素塩変換率 >99%

MspI 切断効率 > 95%

サンプル要件

総量: ≥10 ng

フラグメントサイズ分布: 100-750 bps

サービスのワークフロー

サンプル納品

サンプル納品

ライブラリの準備

図書館の建設

シーケンス

シーケンス

データ分析

データ分析

アフターサービス

アフターサービス


  • 前の:
  • 次:

  • 図91の副本

    次の分析が含まれます。

    ●生データの品質管理

    ● 参照ゲノムへのマッピングに基づくピークコーリング

    ● ピーク関連遺伝子のアノテーション

    ● モチーフ解析: 転写因子結合部位 (TFBS) の同定

    ● 微分ピーク分析と注釈

    転写開始部位 (TSS) 付近の濃縮の評価

     

    図92

     

    CHIPピークのゲノムワイド分布

    写真93

     

    ピーク領域の分類

    写真94

    ピーク関連遺伝子の機能強化 (KEGG)

    写真95

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