16S/18S/そのアンプリコンシーケンス-PACBIO
サービス機能
●シーケンスプラットフォーム：Pacbio Revio
●シーケンスモード：CCS（HIFI読み取り）
●HiFi SMRTベルライブラリの準備の前に、ターゲット領域の増幅後のアンプリコンのタンデムリンク
サービスの利点
●より高い分類学的解像度：tHan Short-Ampliconシーケンス,種レベルでより高いOTU分類率を有効にします。
●非常に正確な基本呼び出し：PACBIO CCSモードシーケンス（HIFI READS）。
●分離なし：環境サンプルにおける微生物組成の迅速な識別。
●広く適用されます：多様な微生物コミュニティ研究。
●包括的なバイオインフォマティック分析：データベース、注釈、OTU/ASVの観点から多様な分析を備えた最新のQIIME2パッケージ（微生物生態学に関する定量的洞察）。
●広範な専門知識：毎年実施される数千のアンプリコンシーケンスプロジェクトにより、Bmkgeneは10年以上の経験、高度なスキルのある分析チーム、包括的なコンテンツ、優れたポストセールスサポートをもたらします。
サービス仕様
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ |
| アンプリコン | Pacbio Revio | 10/30/50 Kタグ（CCS） |
サンプル要件
| 濃度（ng/µL） | 総量（µg） | ボリューム（µL） |
| ≥5 | ≥0.3 | 20以上 |
推奨サンプル配信
サンプルを液体窒素で3〜4時間凍結し、液体窒素または-80度の長期予約に保存します。ドライアイスを使用したサンプル配送が必要です。
サービスワークフロー
サンプル配信
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターセールサービス
次の分析を含めます。
●生データ品質の制御
●OTU Clustering/De-Noise（ASV）
●OTUアノテーション
●アルファダイバーシティ分析：シャノン、シンプソン、エースを含む複数のインデックス。
●ベータダイバーシティ分析
●グループ間分析
●相関分析：環境要因と組成と多様性の間
●16S機能遺伝子予測
分類学的分布のヒストグラム
コミュニティ分布系統樹
アルファダイバーシティ分析：エース
索引
ベータダイバーシティ分析：PCOA
グループ間分析：ANOVA
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、BmkgeneのAmplicon Sequencing ServicesがPacbioで促進する進歩を探ります。
Gao、X。and Wang、H。（2023） 'アルパインメリノヒツジの異なるフェノロジー（再生対草のような）への適応中のルーメン細菌プロファイルと機能の比較分析は、高山の牧草地に2つの成長段階を持つ、発酵、9（9（9） 1）、p。 16。doi：10.3390/fermentation9010016/s1。
Li、S。etal。 （2023）「培養ベースのメタゲノミクスと高解像度分析を使用して、砂漠の土壌で微生物の暗黒物質を捕獲する」、NPJバイオフィルム、マイクロビオーム2023 9：1、9（1）、pp。1–14。 doi：10.1038/s41522-023-00439-8。
Mu、L。etal。 （2022） 'アルファルファ、ライスストロー、小麦Branで調製された混合サイレージの発酵特性、細菌の多様性、および好気性安定性に対する脂肪酸塩の影響、Journal of the Science of Food and Agriculture、102（4）、pp。1475–– pp。1475– 1487。 doi：10.1002/jsfa.11482。
ヤン、J。etal。 （2023） 'Sonchus brachyotus DCからの抽出物の抗酸化効果における酸化ストレスバイオマーカーと腸内微生物叢との相互作用。成人ゼブラフィッシュにおけるオキサゾロン誘発腸酸化ストレス '、抗酸化物質2023、vol。 12、192、12（1）、p。 192。doi：10.3390/antiox12010192。
