16S/18S/そのアンプリコンシーケンス-NGS
サービス機能
●シーケンスプラットフォーム：Illumina Novaseq。
●他の増幅ターゲットの中で、16S、18S、およびITの短い領域の増幅。
●アンプリコンの柔軟な選択。
●複数の増幅ターゲットを使用した以前のプロジェクトの経験。
サービスの利点
●分離なし：環境サンプルにおける微生物組成の迅速な同定。
●高解像度：環境サンプルの低豊富なコンポーネントで。
●広く適用されます：多様な微生物コミュニティ研究。
●包括的なバイオインフォマティック分析：データベース、注釈、OTU/ASVの観点から多様な分析を備えた最新のQIIME2パッケージ（微生物生態学に関する定量的洞察）。
●広範な専門知識：毎年15万人のアンプリコンシーケンスプロジェクトが行われているため、Bmkgeneは10年以上の経験、高度なスキルのある分析チーム、包括的なコンテンツ、優れたポストセールスサポートをもたらします。
サービス仕様
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ |
| アンプリコン | イルミナPE250 | 50/100/300Kタグ（ペアを読む） |
サービス要件
| 濃度（ng/µL） | 総額（ng） | ボリューム（µL） |
| ≥1 | ≥200 | 20以上 |
●土壌/スラッジ：1-2g
●腸の含有量 - 動物：0.5-2g
●腸内コンテンツ - セクト：0.1-0.25g
●植物表面（濃縮堆積物）：0.1-0.5g
●発酵スープが濃縮された堆積物）：0.1-0.5g
●糞便（大型動物）：0.5-2g
●FAECES（マウス）：3-5粒
●肺肺胞洗浄液：ろ紙
●膣スワブ：5-6スワブ
●皮膚/性器スワブ/唾液/経口軟部組織/咽頭スワブ/直腸スワブ：2-3スワブ
●表面微生物：ろ紙
●Waterbody/Air/Biofilm：ろ紙
●内生菌：1-2g
●歯科用プラーク：0.5-1G
サービスワークフロー
サンプル配信
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターセールサービス
次の分析を含めます。
- 生データ品質の制御
- OTUクラスタリング /デノイズ（ASV）
- OTUアノテーション
- Alpha Diversity Analysis：Shannon、Simpson、Aceを含む複数のインデックス。
- ベータダイバーシティ分析
- グループ間分析
- 相関分析：環境要因と組成と多様性の間
- 16S機能遺伝子予測
分類学的分布のヒストグラム
分類学的豊富なクラスタリングヒートマップ
アルファダイバーシティ分析：希薄化曲線
ベータダイバーシティ分析：NMD
グループ間分析：Lefse Biomarker Discovery
キュレーションされた出版物のコレクションを通じて、BmkgeneのAmpliconシーケンスサービスによって促進された進歩を促進します。
ドン、C。etal。 （2022） 'rhiocommia ulmoidesにおける根圏土壌と樹皮微生物叢のアセンブリ、コア微生物叢、および微生物学のフロンティア、13。doi：10.3389/fmicb.2022.855317/full。
Li、Y。etal。 （2023）「マウスにおけるvaginerellellallecrerella誘発性細菌性膣症の治療のための合成細菌コンソーシア移植」、Microbiome、11（1）、pp。1–14。 doi：10.1186/s40168-023-01497-y
Yang、J.、Fu、Y。and Liu、H。（2022） '地上ベースの閉じた生物生成促進実験「月宮殿365」、環境微生物叢、17（1）、pp。 1–20。 doi：10.1186/s40793-022-00399-0/fugures/8。
Yin、S。etal。 （2022）「堆肥化における窒素形質転換に関連する窒素の窒素損失に関連する官能遺伝子の原料依存性存在量」、Bioresource Technology、361、p。 127678。doi：10.1016/j.biortech.2022.127678。
