Small RNA Sequencing-Illumina
תכונות
● הכנת הספרייה כוללת שלב בחירת גודל
● אנליזה ביואינפורמטית התרכזה סביב חיזוי miRNA והמטרות שלהם
יתרונות השירות
●ניתוח ביואינפורמטיקה מקיף:מתן אפשרות לזיהוי הן של miRNAs ידועות והן של חדשניות, זיהוי מטרות miRNA, והערה פונקציונלית מתאימה והעשרה באמצעות מסדי נתונים מרובים (KEGG, GO)
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרה ליבה בכל השלבים, מהכנת דגימות וספרייה ועד רצף וביואינפורמטיקה. ניטור קפדני זה מבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
●תמיכה לאחר מכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי לטפל בכל שאלה הקשורה לתוצאות.
●מומחיות רבה: עם רקורד של סגירה מוצלחת של פרויקטים מרובים של sRNA המכסים למעלה מ-300 מינים בתחומי מחקר שונים, הצוות שלנו מביא ניסיון רב לכל פרויקט.
דרישות לדוגמא ומשלוח
| סִפְרִיָה | פּלַטפוֹרמָה | נתונים מומלצים | נתונים QC |
| גודל נבחר | אילומינה SE50 | 10M-20M קריאות | Q30≥85% |
דרישות לדוגמה:
נוקלאוטידים:
| ריכוז (ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA מוצג על ג'ל. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; גובה בסיס מוגבל או ללא |
● צמחים:
שורש, גבעול או עלה כותרת: 450 מ"ג
עלה או זרע: 300 מ"ג
פירות: 1.2 גרם
● בעל חיים:
לב או מעי: 450 מ"ג
קרביים או מוח: 240 מ"ג
שריר: 600 מ"ג
עצמות, שיער או עור: 1.5 גרם
● פרוקי רגליים:
חרקים: 9 גרם
סרטן: 450 מ"ג
● דם מלא: 2 צינורות
● תאים: 106 תאים
● סרום ופלזמה:6 מ"ל
משלוח לדוגמא מומלץ
מיכל: שפופרת צנטריפוגה 2 מ"ל (לא מומלץ נייר כסף)
תיוג לדוגמה: קבוצה+שכפל, למשל A1, A2, A3; B1, B2, B3.
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור אותן בקרח יבש.
2. צינורות RNAstable: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל RNAstable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודה בשירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
ביואינפורמטיקה
● בקרת איכות נתונים גולמיים
● סיווג sRNA
● יישור לגנום ייחוס
● זיהוי של miRNA ידוע וחדשני
● ניתוח ביטויי miRNA דיפרנציאלי
● ביאור פונקציונלי של יעדי miRNA
זיהוי של מירנה: מבנה ועומק
ביטוי דיפרנציאלי של מירנה - צבירת היררכיה
ביאור פונקציונלי של היעד של miRNAs המבוטא דיפרנציאלי
חקור את ההתקדמות המחקרית המבוצעת על ידי שירותי רצף ה-sRNA של BMKGene באמצעות אוסף אוצרת של פרסומים.
חן, ח' ועוד. (2023) 'זיהומים ויראליים מעכבים את הביוסינתזה והפוטוסינתזה של ספונין ב- Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'חלבון הצמח המכיל תחום FYVE FREE1 מתקשר עם רכיבי מיקרו-מעבד כדי לדכא ביוגנזה של מירנה', מדווח EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
יו, J. et al. (2023) 'ה-MicroRNA Ame-Bantam-3p שולט בהתפתחות הגולם הזחל על ידי מיקוד לתחומים מרובים דמויי גורמי גדילה אפידרמיס 8 (megf8) ב-Honeybee, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'ניתוח משולב של מירנה וגנים הקשורים לאיכות בשר מגלה ש-Gga-MiR-140-5p משפיע על שקיעת שומן תוך שרירית בתרנגולות', פיזיולוגיה תאית וביוכימיה, 46(6), עמ' 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
