
Pacbio באורך מלא
PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, מאפשר זיהוי מדויק של איזופורמי תמלול, שופך אור על פוליאדנילציה ושחבור אלטרנטיביים ומוביל לניתוח ביטוי גנים מדויק יותר. צינור BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome נועד לנתח ספריות cDNA רצף במצב Circular Consensus Sequencing (CCS) ומזהה רצפים ללא אורך מלא (FLNC), אשר מקובצים לאחר מכן לתמלילים שאינם מיותרים. ניתוח BUSCO שלאחר מכן מעריך את שלמות הרכבת ה-transcriptome. מהתעתיק המורכב, מבוצעות ניתוחים מרובים: שחבור אלטרנטיבי, חזרה על רצף פשוט (SSR), חיזוי של lncRNA וגנים מתאימים למטרה, חיזוי של גנים חדשים, ניתוח משפחות גנים, ניתוח גורמי שעתוק וביאור פונקציונלי של תמלילים.
ביואינפורמטיקה
